More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2897 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  777    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  81.82 
 
 		 363 aa  607  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  53.82 
 
 		 385 aa  351  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  52.51 
 
 		 445 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5122  PfkB domain protein  55.62 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  54.31 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1520  PfkB domain protein  51.74 
 
 		 371 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.395402  normal  0.0514354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  52.38 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  29.04 
 
 		 319 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5442  PfkB domain protein  35.94 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  32.65 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  26.96 
 
 		 319 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  29.05 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.37 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.42 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.32 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  28.76 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.77 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  32.8 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  27.61 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  25.97 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  29.93 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  27.18 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.66 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  40.83 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.9 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  24.83 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  24.76 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  28.66 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  27.05 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  28.94 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  24.93 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  28.39 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  26.48 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  27.07 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  27.73 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  26.17 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.93 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.13 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  25.9 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  28.67 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.45 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  28.01 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  24.21 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  29.32 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  27.3 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  24.14 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 		 300 aa  67  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.9 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  22.01 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  23.78 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.75 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  26.3 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  28.35 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  22.77 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.32 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.26 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  27.97 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  31.42 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  27.39 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  27 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  26.32 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  30.53 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  29.09 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  32.72 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  21.77 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  36.84 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  26.03 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.48 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  26.97 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  26.79 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  26.97 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  28.78 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  27.15 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  27.42 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  24.25 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  26.97 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  25.77 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  37.5 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  26.67 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  27.81 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  25.77 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  27.42 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  26.64 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  26.64 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  30.07 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  28.42 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  27.17 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  27.46 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  27.57 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.48 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  25.07 
 
 		 646 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  27.09 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  22.29 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  35.58 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>