More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1520 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1520  PfkB domain protein  100 
 
 		 371 aa  743    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.395402  normal  0.0514354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  58.74 
 
 		 385 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  51.79 
 
 		 363 aa  348  6e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5122  PfkB domain protein  57.18 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  51.45 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  51.57 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  51.29 
 
 		 445 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  52.55 
 
 		 373 aa  299  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 		 319 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  32.48 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  25.95 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 		 304 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.79 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.03 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  29.58 
 
 		 307 aa  86.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  28.81 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5442  PfkB domain protein  30.63 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  26.91 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.28 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  26.28 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  28.7 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  27.39 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  29.14 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  27.12 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.27 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.44 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  28.39 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  33.22 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.25 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.25 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.25 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  26.89 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.25 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.25 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  22.9 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.25 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.25 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.66 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  28.25 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  27.4 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  27.34 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  24.14 
 
 		 302 aa  67  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.97 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.84 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  28.95 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  23.84 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  27.03 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  27.01 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  27.24 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  28.16 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  24.6 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  26.49 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  27.56 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  26.92 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.14 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  23.81 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  23.81 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  30.92 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  26.32 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  27.67 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  29.14 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  25.49 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  24.31 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  26.17 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  28.04 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  26.01 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  26.17 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  28.43 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  26.35 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.71 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  25.84 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  23.13 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.25 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  26.35 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  26.35 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  26.91 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  21.9 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  25.37 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  21.23 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  26.32 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  24.11 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  27.05 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  42.42 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  40.54 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  22.93 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  28.62 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  29.08 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  29.32 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  23.57 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  28.62 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  29.32 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  29.32 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  24.92 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.06 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>