More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6055 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6055  PfkB domain protein  100 
 
 		 312 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5850  ribokinase  76.09 
 
 		 321 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0735551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  42.66 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  43.93 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  44.48 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2300  PfkB  34.18 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.171843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  37.99 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  31.85 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  44.07 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  35.53 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  40.88 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  37.05 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  33.67 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  34.34 
 
 		 398 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  39.09 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  36.7 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40.6 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  35.43 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  35.31 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  40.72 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  37.5 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  38.93 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  35.64 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  36.86 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  35.54 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  36.96 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  40.28 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  38.01 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  38.89 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  37.33 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  33.33 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  41.9 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  36.22 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  30.54 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  33.89 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  32.06 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  33.11 
 
 		 403 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  29.18 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  28.85 
 
 		 404 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  28.85 
 
 		 404 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  33.99 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  28.85 
 
 		 404 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  36.64 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  39.14 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  36.3 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  28.85 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  38.2 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  35.74 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  34.98 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35.71 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  31.77 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  31.27 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  31.27 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  31.27 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  31.27 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  31.27 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  34.78 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  41.06 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  39.04 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  37.09 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  31.77 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  33.88 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  34.83 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  36.88 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  39.93 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  35.05 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  40.4 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  33.44 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  33.22 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  36.82 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  28.99 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  33.22 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  37.38 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  32.03 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  33.22 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  33.22 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  32.54 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  33.22 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  36.3 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  36.88 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  31.97 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  32.88 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  34.75 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  31.97 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  36.07 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  38.93 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  36.07 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  34.67 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  38.93 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  36.07 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  36.07 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  37.92 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  36.07 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  36.07 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  35.43 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  33.88 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  34.78 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  42.61 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  34.78 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  36.07 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>