More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1202 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  577  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  91.28 
 
 		 296 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  49.66 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  43.32 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  40.53 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  49.66 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  43.38 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  42.39 
 
 		 313 aa  202  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  44.41 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  43.39 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  35.86 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  38.61 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.8 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  38.46 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.58 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  36.45 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  40.27 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  41.61 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  40.73 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  36.96 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  42.62 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  50.17 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.54 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  40.59 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  39.07 
 
 		 308 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  39.54 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  44 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  39.54 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  39.54 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  43.05 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  43.96 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  41.2 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  46.53 
 
 		 300 aa  185  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  40.53 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  43.14 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  35.26 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  43.73 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  40.6 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  43.52 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  43 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  45.08 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  40.27 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  41.53 
 
 		 299 aa  178  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  39.39 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.21 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  34.29 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  39.6 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  35.33 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  37.79 
 
 		 297 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  32.88 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  41.41 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  41.41 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  41.08 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  37.09 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  41.41 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  41.41 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  41.41 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  41.41 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  41.41 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  41.41 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  36.07 
 
 		 304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  39.8 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  36.07 
 
 		 304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  33.88 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  39.8 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  39.8 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  39.8 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.74 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  41.58 
 
 		 295 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  36.36 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  39.75 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  36.7 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  39.26 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  40.73 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  40.67 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  31.76 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  42.71 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  44.85 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  36.36 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  36.7 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  37.91 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  36.36 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  38.74 
 
 		 310 aa  168  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  36.36 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  36.36 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  36.36 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  36.36 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  41.95 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  46 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  40.26 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  38.93 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  48.96 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  37.09 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  36.03 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  40.07 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  42 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  42 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  38.28 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>