More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3544 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  99.65 
 
 		 285 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  99.65 
 
 		 285 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2643  ribokinase  67.48 
 
 		 286 aa  295  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3935  ribokinase  65.51 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12463  ribokinase rbsK  62.82 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  33.67 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  45.24 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  40.61 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  34.54 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  41.33 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  45.93 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  44.41 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  38.21 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  42.32 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  36.89 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  38.69 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  35.33 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  37.17 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  36.15 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  39.18 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  37.07 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  38.49 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  37.7 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  36 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  34.45 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  36.59 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  35.49 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  34.88 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  37.25 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  35.71 
 
 		 298 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0652  PfkB domain-containing protein  45.53 
 
 		 277 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  33.99 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  35.74 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  38.74 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  35.71 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  37.91 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  35.62 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  38.31 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  35.35 
 
 		 305 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  35.62 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  35.62 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  34.93 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  35.62 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  31.61 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  35.27 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  36.52 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  38.38 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  34.81 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  39.93 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  34.43 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  30 
 
 		 345 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  30.59 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  38.52 
 
 		 315 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  40.36 
 
 		 324 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  41.89 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  36.13 
 
 		 353 aa  137  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  40.61 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  42.71 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  37.33 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  39.23 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  34.65 
 
 		 306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  34.1 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  31.92 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  30.94 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  37.16 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  36.78 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  37.16 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  36.88 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  31.68 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  37.16 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  37.16 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  36.88 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  38.78 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  36.88 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  36.88 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  36.88 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  36.88 
 
 		 314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  36.12 
 
 		 314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  36.21 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  36.88 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  36.24 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  36.88 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  38.31 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  40.86 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  35 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  36.42 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  31.15 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  35.5 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  34.65 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1176  PfkB domain protein  43.48 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.156952  normal  0.0586997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  37.46 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  36.5 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  36.42 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  37.05 
 
 		 311 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  37.05 
 
 		 311 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  42.52 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>