More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1559 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  100 
 
 		 286 aa  540  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  45.2 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  45.07 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  45.07 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  44.18 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  42.57 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  42.9 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  42.9 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  42.9 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  42.43 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39.59 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  42.43 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  42.43 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  42.43 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  42.43 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  42.57 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  42.57 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  34.9 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  42.57 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  42.57 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  42.24 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  39.55 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  39.8 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  39.8 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  39.8 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  40.92 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  40.86 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  39.54 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  39.93 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  43.19 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  44.22 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  40.94 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  43.19 
 
 		 309 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  38.49 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  37.16 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.75 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.82 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  40.94 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  38.54 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  36.27 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  37.34 
 
 		 317 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  39.87 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  35.71 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  41.14 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  39.4 
 
 		 308 aa  158  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  38.24 
 
 		 306 aa  158  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.79 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  37.21 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  42.47 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  40.2 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  42.96 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.16 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  40.68 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  35 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  38.69 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  35 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  33.66 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  38.08 
 
 		 306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38.11 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  37.68 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  42.52 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  43.51 
 
 		 304 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  49.41 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  39 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  42 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12463  ribokinase rbsK  46.15 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  38.36 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  46 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  33.88 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  43.92 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  39.39 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0652  PfkB domain-containing protein  45.9 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3935  ribokinase  46.67 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  44.14 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  41.26 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  42.31 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  42.14 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2643  ribokinase  45.04 
 
 		 286 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  43.75 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  43.75 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  47.04 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  38.76 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  39.27 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  37.09 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  38.58 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  40.35 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  31.71 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  43.18 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  40.45 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  38.62 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  40.47 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  40.23 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  41.55 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  39.87 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2012  PfkB domain protein  42.86 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0768209  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  37.66 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  43.7 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  40.13 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  37.5 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  32.89 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>