More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4125 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 280 aa  583  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  68.57 
 
 		 283 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  68.21 
 
 		 283 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  69.29 
 
 		 283 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  69.06 
 
 		 279 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  68.21 
 
 		 283 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  67.87 
 
 		 284 aa  374  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  68.59 
 
 		 279 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  67.99 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  68.59 
 
 		 279 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  69.42 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  66.19 
 
 		 281 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  67.86 
 
 		 286 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  66.91 
 
 		 279 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3518  carbohydrate kinase  67.99 
 
 		 292 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  63.18 
 
 		 282 aa  338  8e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  23.25 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  22.34 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  25.4 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  23.62 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  28.01 
 
 		 290 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  25.1 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  22 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  23.41 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  25.1 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  27.16 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  23.95 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  25.45 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  23.16 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  23.16 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  24.91 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  22.34 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  22.81 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  23.98 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  25.75 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  22.81 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  22.81 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  23.59 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  21.18 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  23.51 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  24.47 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  25.88 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.47 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  21.5 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  27.21 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  23.33 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  22.17 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  22.53 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  24.1 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  21.74 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  22.94 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  24.29 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  26.19 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  23.43 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  23.73 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  38.46 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  26.19 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  23.66 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  22.43 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  22.75 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  20.76 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  25.83 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  22.75 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  22.06 
 
 		 403 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  26.72 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  22.06 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  23.9 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  22.81 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  24.19 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  24.63 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  19.4 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  23.83 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  22.58 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  22.53 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  23.4 
 
 		 424 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  19.4 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  23.58 
 
 		 335 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  25 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  21.55 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  21.75 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  25.97 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  22.66 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  22.52 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  26.03 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  24.27 
 
 		 318 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  23.76 
 
 		 330 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  24.05 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20791  putative carbohydrate kinase  44.74 
 
 		 338 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  27.31 
 
 		 333 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  22.36 
 
 		 336 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  43.24 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  22.67 
 
 		 344 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  24.26 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  24.26 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  24.26 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  21.94 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  20.33 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  21.83 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  24.26 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>