More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0383 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  91.07 
 
 		 283 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  90.36 
 
 		 283 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  90.36 
 
 		 283 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  89.93 
 
 		 279 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  90.36 
 
 		 283 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  88.85 
 
 		 279 aa  487  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  89.57 
 
 		 279 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  88.49 
 
 		 279 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  76.53 
 
 		 279 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  74.01 
 
 		 279 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  75.18 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  67.87 
 
 		 280 aa  377  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  70.71 
 
 		 282 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  70.36 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3518  carbohydrate kinase  71.43 
 
 		 292 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  25.91 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  28.69 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  25.6 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  23.74 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.05 
 
 		 398 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  26.32 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.54 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  21.9 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  25.52 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  23.08 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.37 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  25.84 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  24.9 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  28.23 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  25.1 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  26.91 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  25.1 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  25.47 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.23 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  25.47 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  25.47 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  25.47 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  24.22 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  27.54 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  28.69 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  23.61 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.4 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  24.19 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  22.76 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  25.1 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  24.24 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  22.3 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  25 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  23.83 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  20 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  20 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  24.71 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  21.62 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  26.05 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  24.41 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  23.1 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  25.37 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  25.3 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  27.88 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  25.3 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  24.1 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  24.81 
 
 		 336 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  27.88 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  24.35 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  24.37 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  26.12 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  22.73 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  25.51 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  24.43 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  25.78 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.83 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  22.37 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  22.37 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  22.37 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.18 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  24.37 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  24.31 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  25.31 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  22.46 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  24.47 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  25 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  22.73 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  25.3 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  22.12 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  25.4 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  24.02 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  22.48 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  27.57 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  25.62 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  23.97 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  26.37 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  23.41 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75489  ribokinase  22.55 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  22.65 
 
 		 404 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  23.29 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  22.65 
 
 		 404 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  23.29 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  23.95 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>