More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4412 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  84.17 
 
 		 279 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  76.34 
 
 		 279 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  75.63 
 
 		 279 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  75.63 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  75.63 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  76.26 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  76.62 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  76.26 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  76.34 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  76.62 
 
 		 283 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  75.18 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  70.04 
 
 		 282 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  70.36 
 
 		 281 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3518  carbohydrate kinase  70.76 
 
 		 292 aa  361  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  66.91 
 
 		 280 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  30 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  26.57 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.75 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  26.91 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  26.91 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  21.85 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  21.85 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25.38 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  28.01 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  27.31 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  27.24 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.69 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.09 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  26.91 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  22.26 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  26.29 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  25.1 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  24.91 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  28.35 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  25.2 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  26.1 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  26.21 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  24.48 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  24.74 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  26.22 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  23.93 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  27.02 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  27.63 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  27.65 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  24.72 
 
 		 338 aa  62  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  22.11 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  29.8 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  25.34 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  23.22 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  24.9 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  27.94 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  26.22 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  22.22 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  23.76 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.69 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  26.04 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  23.53 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  23.02 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  22.56 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  24.68 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  25.19 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  24.11 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  23.42 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  24.81 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  27.82 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  24.81 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  26.75 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.84 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  25.26 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  25.87 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  25.87 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  25.87 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  25.87 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  22.92 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  26.19 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  27.8 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  22.83 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  24.37 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  27.4 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  24.66 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16505  Rfae domain I  24.83 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119245  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  25.17 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  23.05 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  25.1 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  23.66 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  26.14 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  27 
 
 		 360 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  24.09 
 
 		 445 aa  57  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  20.71 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  24.31 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  22.07 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  24.65 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  24.19 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>