128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4333 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4333  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  304  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  36.44 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  38.21 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  32.54 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  30.37 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  32 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  32.81 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  31.93 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  34.62 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  30.6 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  29.77 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  30.4 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  30.4 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.71 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.96 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  34.17 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  35.43 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  31.97 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  36.15 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  35.16 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  35.16 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  33.65 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  36.94 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  28.24 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  33.05 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  33.07 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  32.59 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  33.58 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  40.38 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  27.27 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  34.85 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  34.85 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  34.85 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  31.01 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  29.2 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  35 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  34.78 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  33.07 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  35.11 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  34.38 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  28.47 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  34.65 
 
 		 207 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  35.66 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  30.65 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  32.38 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  29.84 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  29.2 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  31.58 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  36.73 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  32.8 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  29.7 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  27.69 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  38.46 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  25.2 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  28.1 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  29.2 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  32.43 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  38.38 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  31.5 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  35 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  35 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  29.92 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  37.86 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  30.16 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  37.86 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  30.77 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  31.2 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  27.01 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  31.53 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  33.57 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  29.37 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  33.06 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  35.92 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  34.68 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  29.13 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  32.58 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  32.11 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  30.16 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  35.24 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  26.67 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  30.1 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  31.5 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  32.74 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>