More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2446 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2446  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 601 aa  1154    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.57665  normal  0.0973248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  46.43 
 
 		 518 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5594  histidine kinase  34.87 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 564 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.452469  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1909  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.61 
 
 		 391 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114776  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  32.27 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 424 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  34.97 
 
 		 420 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  49.08 
 
 		 313 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  36.93 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.26 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  35.85 
 
 		 395 aa  104  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.52 
 
 		 379 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 416 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 469 aa  97.1  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 394 aa  94.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 424 aa  94  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  29.11 
 
 		 430 aa  94  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  37.5 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 383 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.14 
 
 		 430 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 413 aa  90.9  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.1 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.88 
 
 		 367 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  40.83 
 
 		 425 aa  89  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.13 
 
 		 371 aa  88.2  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 417 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 418 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  31.88 
 
 		 403 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.99 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.2 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  35.59 
 
 		 371 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  32.79 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  36.13 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.41 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  36.15 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  31.41 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  29.69 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  34.77 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  35.93 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  37.19 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  31.28 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  30.46 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.93 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  38.55 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  41.18 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.6 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 421 aa  76.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 453 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 441 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  33.98 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02410  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.68 
 
 		 567 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.09 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  36.98 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.46 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  31.8 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  35.97 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  29.59 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  36.19 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0638  histidine kinase  31.3 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.509372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  33.02 
 
 		 381 aa  73.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  29.97 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 426 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  38.42 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  38.62 
 
 		 389 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  31.36 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.72 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  34.95 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  31.73 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.81 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  33.49 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 612 aa  71.2  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  35.98 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33.17 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  31.05 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  30.34 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  35.68 
 
 		 407 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  32.95 
 
 		 393 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  34.03 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>