More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1909 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1909  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
391 aa  751    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114776  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  45.03 
 
 
518 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 
536 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2446  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.06 
 
 
601 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.57665  normal  0.0973248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  45.58 
 
 
555 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  48.13 
 
 
313 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  40.23 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.57 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.27 
 
 
379 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  39.76 
 
 
395 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5594  histidine kinase  41.63 
 
 
432 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  41.52 
 
 
393 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.23 
 
 
384 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
416 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  43.3 
 
 
393 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
564 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.452469  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
424 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  37.1 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
398 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
449 aa  116  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.8 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.66 
 
 
567 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  44.5 
 
 
434 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  42.33 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  38.07 
 
 
438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  33.08 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.15 
 
 
419 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.48 
 
 
370 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
387 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
435 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.75 
 
 
371 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.53 
 
 
446 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.96 
 
 
398 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.19 
 
 
421 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  34.36 
 
 
425 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  38.05 
 
 
369 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  34 
 
 
414 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  35.48 
 
 
437 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
441 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
360 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
430 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.13 
 
 
399 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
391 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  35.11 
 
 
424 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  41.12 
 
 
389 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.01 
 
 
399 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  37.56 
 
 
403 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  33.33 
 
 
375 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
426 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  33.22 
 
 
409 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.09 
 
 
442 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
401 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  37.8 
 
 
372 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.5 
 
 
386 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  34.6 
 
 
371 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  33.44 
 
 
402 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  33.05 
 
 
392 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  33.33 
 
 
407 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
382 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  36.2 
 
 
393 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  37.67 
 
 
422 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
423 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
394 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
418 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
400 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
442 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
422 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  37.33 
 
 
399 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
406 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  30.45 
 
 
433 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
417 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  37 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.55 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.35 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  36.9 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.51 
 
 
430 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  30.1 
 
 
430 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
496 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000683339  hitchhiker  0.000292513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  36.32 
 
 
445 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  33.33 
 
 
408 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  37.72 
 
 
374 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  35.22 
 
 
426 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.54 
 
 
389 aa  96.3  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
441 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.61 
 
 
395 aa  96.3  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
406 aa  96.3  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  36.05 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6236  histidine kinase  39.55 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.39934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  35.94 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  35.16 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  34.87 
 
 
428 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  35.03 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>