More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4253 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 564 aa  1085    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.452469  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.9 
 
 		 536 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  34.46 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2446  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.59 
 
 		 601 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.57665  normal  0.0973248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  35.36 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  39.78 
 
 		 420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.09 
 
 		 415 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  36.71 
 
 		 395 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 424 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  30.72 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  36.14 
 
 		 388 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  36.29 
 
 		 371 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  34.5 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1909  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.58 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114776  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  40.43 
 
 		 313 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  30.93 
 
 		 442 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  30.95 
 
 		 399 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 424 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 373 aa  97.8  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 422 aa  94  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  33.94 
 
 		 369 aa  93.2  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  34.02 
 
 		 375 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.82 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 401 aa  92.8  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 394 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  30.8 
 
 		 423 aa  91.3  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 387 aa  90.9  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  31.61 
 
 		 403 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  35.48 
 
 		 422 aa  90.1  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5594  histidine kinase  40.7 
 
 		 432 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.81 
 
 		 357 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33.87 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.64 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 500 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 360 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.37 
 
 		 384 aa  87.8  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.04 
 
 		 371 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  37.28 
 
 		 434 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  27.95 
 
 		 405 aa  87  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 445 aa  87  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  31.01 
 
 		 402 aa  87  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.47 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  33.63 
 
 		 351 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.25 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  36.08 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  30.2 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  31.87 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.39 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  36.29 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  30.15 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  29.37 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.54 
 
 		 419 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  33.06 
 
 		 392 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  37.1 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  33.55 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  37.23 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.09 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  32.87 
 
 		 395 aa  80.1  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  28.57 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 421 aa  80.1  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  28.49 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  33.73 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  32.92 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.61 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  35 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.36 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  34.35 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  33.33 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  35.43 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.83 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 435 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  30.04 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  30.6 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  31.88 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  25.78 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  28.83 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.67 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  31.56 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  30.31 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 869 aa  74.7  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>