More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5594 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5594  histidine kinase  100 
 
 		 432 aa  839    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  44.29 
 
 		 518 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 536 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2446  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.31 
 
 		 601 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.57665  normal  0.0973248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  31.96 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1909  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.53 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114776  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  42.14 
 
 		 555 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  47.29 
 
 		 313 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  40.67 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.76 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.56 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.45 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  47 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  53.06 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.62 
 
 		 379 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  41.58 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.23 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  44.04 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.42 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  45.83 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.87 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  40.65 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  42.99 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  40.37 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  49.44 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  41.12 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  47.31 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4861  histidine kinase  48.31 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.97 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  50 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  40.83 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  48.81 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.69 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.86 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.07 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  42.22 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.01 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  35.54 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  41.41 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  45.16 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  39.45 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  36.43 
 
 		 371 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  41.86 
 
 		 376 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.18 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  35 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  47.06 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  46.15 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  40.74 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  45.74 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  39.17 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  40 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.62 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  41.75 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  48.86 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  29.71 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  36.75 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1768  histidine kinase  40 
 
 		 666 aa  63.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.686261  normal  0.0755696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 612 aa  63.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  43.01 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1618  histidine kinase  40.38 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.790794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4068  histidine kinase  46.67 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.419226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  35.44 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.31 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.4 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  41.58 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  40.86 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  40.78 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  39.6 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  34.11 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  35.62 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  44.34 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  44.57 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  42.53 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  27.57 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>