More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4068 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4068  histidine kinase  100 
 
 		 383 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.419226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  43.56 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 420 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 441 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  38.73 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  35.44 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.22 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  39.04 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  38.79 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  40.61 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.45 
 
 		 424 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  37.24 
 
 		 381 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  35.75 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 398 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  34.77 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  39.12 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  41.31 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  37.06 
 
 		 408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  44.98 
 
 		 447 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  35.28 
 
 		 405 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  45.07 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  35.56 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.98 
 
 		 407 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  40.57 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.18 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  40.89 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3487  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.51 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.92 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  42.11 
 
 		 457 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.39 
 
 		 392 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  36.42 
 
 		 395 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  42.2 
 
 		 393 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  36.84 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  36.55 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  31.49 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  43.18 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  36.1 
 
 		 380 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16870  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 475 aa  123  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.881829  normal  0.0427028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 424 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0645  histidine kinase  26.44 
 
 		 849 aa  122  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.386333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 869 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  42.73 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  45.18 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  42.19 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 441 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.37 
 
 		 271 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.48 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  41.89 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.32 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  41.35 
 
 		 419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.09 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.86 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  40.57 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  32.37 
 
 		 379 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  36.12 
 
 		 462 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.86 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  38.46 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  37.91 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 		 438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  33.85 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  40.87 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.36 
 
 		 438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  35.91 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  34.72 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  39.09 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.71 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  33.9 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  38.22 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  30.72 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.98 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 416 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.4 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  33.91 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.83 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.58 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  38 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36.43 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.96 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>