More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0645 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0645  histidine kinase  100 
 
 		 849 aa  1748    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.386333 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 869 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 394 aa  156  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 420 aa  147  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  26.39 
 
 		 423 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  34.39 
 
 		 422 aa  138  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  27.11 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  25.63 
 
 		 443 aa  135  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  28.63 
 
 		 407 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 500 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 406 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 441 aa  114  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 445 aa  114  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  30.22 
 
 		 421 aa  114  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 416 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.8 
 
 		 386 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.96 
 
 		 407 aa  110  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 601 aa  109  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  32.72 
 
 		 447 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  30.33 
 
 		 417 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 418 aa  108  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  32.47 
 
 		 367 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.39 
 
 		 424 aa  108  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.53 
 
 		 430 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  29.27 
 
 		 399 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  24.39 
 
 		 384 aa  106  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  29 
 
 		 389 aa  105  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 469 aa  105  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 441 aa  104  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  31.98 
 
 		 400 aa  104  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 417 aa  104  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.46 
 
 		 406 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  26.55 
 
 		 424 aa  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  30.71 
 
 		 410 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.9 
 
 		 378 aa  103  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  30.18 
 
 		 388 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 424 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 394 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  28.04 
 
 		 449 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02990  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 419 aa  101  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  32.69 
 
 		 408 aa  101  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  26.54 
 
 		 399 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  25 
 
 		 446 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 398 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  28.57 
 
 		 369 aa  99.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  28.99 
 
 		 462 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 445 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 441 aa  99  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 398 aa  99  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  27.08 
 
 		 430 aa  99.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  30.18 
 
 		 393 aa  99.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  31.92 
 
 		 384 aa  98.6  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  28.87 
 
 		 388 aa  98.6  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  29.69 
 
 		 374 aa  98.2  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  28.64 
 
 		 393 aa  97.8  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 405 aa  97.8  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  30.67 
 
 		 402 aa  97.8  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 439 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 387 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  29.74 
 
 		 430 aa  97.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 372 aa  96.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  29.88 
 
 		 438 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  27.93 
 
 		 401 aa  96.3  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  29.79 
 
 		 405 aa  95.9  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  26.27 
 
 		 439 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.67 
 
 		 401 aa  95.9  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  27.07 
 
 		 408 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 438 aa  95.5  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  28.81 
 
 		 433 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  29.82 
 
 		 419 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  28.96 
 
 		 393 aa  95.5  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 394 aa  95.5  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.28 
 
 		 383 aa  94.7  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  31.86 
 
 		 375 aa  94  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  28.99 
 
 		 392 aa  94  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  26.69 
 
 		 455 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 424 aa  94  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  31.14 
 
 		 372 aa  92.8  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  29.77 
 
 		 380 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4068  histidine kinase  25.42 
 
 		 383 aa  93.6  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.419226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.45 
 
 		 567 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  28.52 
 
 		 395 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  32.29 
 
 		 376 aa  93.2  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 420 aa  93.2  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  26.94 
 
 		 395 aa  92.8  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.69 
 
 		 379 aa  92.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  30.84 
 
 		 389 aa  92.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.62 
 
 		 371 aa  92.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  29.6 
 
 		 443 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  29.07 
 
 		 408 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 379 aa  91.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 440 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.31 
 
 		 415 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  27.08 
 
 		 478 aa  91.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  28.25 
 
 		 388 aa  91.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  28.18 
 
 		 389 aa  91.3  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  27.24 
 
 		 422 aa  91.3  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 426 aa  91.3  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 404 aa  90.9  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  30.56 
 
 		 393 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>