More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0638 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0638  histidine kinase  100 
 
 		 381 aa  749    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.509372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  41.94 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  39.13 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.05 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.39 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  38.46 
 
 		 430 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  37.56 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  34.43 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.21 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  35.27 
 
 		 393 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 440 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  37.74 
 
 		 428 aa  99.4  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  31.89 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  37.35 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  35.81 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.24 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  31.85 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.95 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2538  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  30.99 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 394 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 441 aa  96.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  36.99 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  33.98 
 
 		 421 aa  96.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  34.13 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  31.42 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  34.35 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.78 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  35.98 
 
 		 555 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.86 
 
 		 443 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.32 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.1 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 412 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  31.78 
 
 		 423 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 652 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  35.56 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.61 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  29.36 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  35.89 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  32.78 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.76 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  38.66 
 
 		 470 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  34.33 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  34.15 
 
 		 402 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  34 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4946  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 793 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  31.82 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  34.74 
 
 		 518 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.15 
 
 		 401 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  36.49 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  35.44 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33.75 
 
 		 433 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  35.14 
 
 		 399 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  31.52 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  33.33 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  30.43 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  35.19 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.37 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  33.2 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  34.53 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  32.17 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.56 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3474  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.89 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  32.28 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 596 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  32.83 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  31.56 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 612 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  31.88 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 426 aa  87  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  32.5 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  36.76 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  28.74 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  34.29 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.43 
 
 		 400 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>