More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0655 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0655  GDP-mannose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  877    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4437  GDP-mannose 6-dehydrogenase  55.95 
 
 		 438 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.379553  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1288  GDP-mannose 6-dehydrogenase  55.71 
 
 		 438 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5882  nucleotide sugar dehydrogenase  52.27 
 
 		 437 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.969972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  55.24 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4561  GDP-mannose 6-dehydrogenase  55.71 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1243  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  54.52 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1063  GDP-mannose 6-dehydrogenase  54.05 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.763895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0889  nucleotide sugar dehydrogenase  55.24 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1031  GDP-mannose 6-dehydrogenase  53.06 
 
 		 436 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1678  GDP-mannose 6-dehydrogenase  51.81 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10970  GDP-mannose 6-dehydrogenase  53.57 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1605  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  49.77 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18580  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  50 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.156779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0673  GDP-mannose 6-dehydrogenase  50.68 
 
 		 438 aa  438  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0577586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3792  GDP-mannose 6-dehydrogenase  49.05 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2940  nucleotide sugar dehydrogenase  41.91 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1896  GDP-mannose 6-dehydrogenase  40.13 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883945  normal  0.0307058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3220  GDP-mannose 6-dehydrogenase  41.45 
 
 		 421 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.712763  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3885  nucleotide sugar dehydrogenase  42.3 
 
 		 420 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1699  GDP-mannose 6-dehydrogenase  40.69 
 
 		 419 aa  302  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.18 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  34.78 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  38.39 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.66 
 
 		 447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.27 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.64 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  36.01 
 
 		 486 aa  236  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.32 
 
 		 428 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  37.64 
 
 		 453 aa  232  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  37.75 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  35.86 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.81 
 
 		 425 aa  222  9e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.09 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.75 
 
 		 421 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  36.72 
 
 		 457 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  35.52 
 
 		 451 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.36 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  37.29 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  37.17 
 
 		 449 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  37.17 
 
 		 449 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5424  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.21 
 
 		 429 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  38.16 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.61 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.67 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  32.58 
 
 		 427 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.22 
 
 		 445 aa  213  7.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.73 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  35.36 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  36.29 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.01 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  35.82 
 
 		 464 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  36.06 
 
 		 459 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.99 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.2 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.64 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  36.26 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  37.64 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  35.31 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  36.26 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  34.66 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.34 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.83 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  33.17 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  35.83 
 
 		 436 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  35.83 
 
 		 435 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.39 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  33.18 
 
 		 448 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  34.87 
 
 		 463 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.14 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  36.81 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.6 
 
 		 472 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.91 
 
 		 445 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  34.75 
 
 		 473 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.58 
 
 		 450 aa  203  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.61 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.61 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  33.66 
 
 		 445 aa  202  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.5 
 
 		 448 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  34.99 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.27 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  34.38 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.25 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  36.31 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.51 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  32.85 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  33.07 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  36.46 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.35 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.9 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.51 
 
 		 442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  35.09 
 
 		 450 aa  200  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  34.27 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.25 
 
 		 463 aa  199  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  36.19 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.75 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  32.23 
 
 		 475 aa  199  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.79 
 
 		 450 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.08 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.15 
 
 		 456 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>