More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2113 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
428 aa  874    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.86 
 
 
426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.59 
 
 
425 aa  566  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.43 
 
 
421 aa  537  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.1 
 
 
425 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.36 
 
 
431 aa  474  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  45.29 
 
 
432 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  44.44 
 
 
429 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  45.85 
 
 
431 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  46.28 
 
 
446 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  43.27 
 
 
451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1120  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.29 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  44.6 
 
 
427 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.22 
 
 
424 aa  345  7e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  42.69 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.86 
 
 
478 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  43.61 
 
 
443 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.53 
 
 
457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  45.5 
 
 
440 aa  329  6e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  41.19 
 
 
440 aa  328  9e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  38.85 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  44.68 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  42.86 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.56 
 
 
447 aa  327  3e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.84 
 
 
443 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.26 
 
 
460 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  44.88 
 
 
435 aa  324  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.14 
 
 
472 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  41.82 
 
 
436 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  41.82 
 
 
435 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.94 
 
 
467 aa  321  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  41.04 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.75 
 
 
440 aa  320  3e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.95 
 
 
440 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.36 
 
 
436 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  40.68 
 
 
449 aa  319  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.68 
 
 
467 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.03 
 
 
438 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  42.69 
 
 
451 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.72 
 
 
466 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.75 
 
 
438 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.1 
 
 
441 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  42.3 
 
 
438 aa  316  5e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  40.71 
 
 
458 aa  315  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.86 
 
 
456 aa  315  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  43.06 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.13 
 
 
462 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.49 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.13 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.41 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  42.82 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.13 
 
 
462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.94 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.92 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.08 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.13 
 
 
456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.45 
 
 
447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  40.53 
 
 
449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.65 
 
 
441 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  39.55 
 
 
467 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.41 
 
 
436 aa  312  9e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.38 
 
 
457 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  40.43 
 
 
456 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  40.71 
 
 
427 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.16 
 
 
434 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  42 
 
 
437 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  41.16 
 
 
433 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.37 
 
 
440 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.7 
 
 
451 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  42.59 
 
 
441 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.94 
 
 
442 aa  310  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.89 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.84 
 
 
445 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.89 
 
 
456 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.57 
 
 
436 aa  309  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.3 
 
 
450 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  41.18 
 
 
438 aa  308  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.26 
 
 
438 aa  308  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  40.38 
 
 
522 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  41.18 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  41.15 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.68 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.92 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  40.36 
 
 
447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  39.44 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  39.15 
 
 
437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.6 
 
 
470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.47 
 
 
434 aa  307  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.7 
 
 
434 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.04 
 
 
462 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  40 
 
 
453 aa  307  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  39.15 
 
 
437 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  43.66 
 
 
442 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  39.58 
 
 
453 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.32 
 
 
444 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.92 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.72 
 
 
473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.12 
 
 
440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.12 
 
 
440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>