More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0207 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
421 aa  837    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.48 
 
 
425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.7 
 
 
428 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.61 
 
 
426 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.53 
 
 
425 aa  537  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.99 
 
 
431 aa  482  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  52.3 
 
 
431 aa  409  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  51.15 
 
 
432 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  50 
 
 
429 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1120  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.96 
 
 
309 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  49.28 
 
 
446 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  44.91 
 
 
451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  43.03 
 
 
427 aa  355  7.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  44.74 
 
 
486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.12 
 
 
424 aa  342  9e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  48.06 
 
 
431 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.6 
 
 
467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  44.85 
 
 
454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  43.37 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  43.34 
 
 
459 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.76 
 
 
443 aa  334  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  44.5 
 
 
454 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.41 
 
 
457 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  43.49 
 
 
440 aa  330  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  44.22 
 
 
467 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  42.65 
 
 
438 aa  330  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.99 
 
 
438 aa  330  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.23 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.69 
 
 
442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.06 
 
 
436 aa  326  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  45.97 
 
 
433 aa  325  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  44.26 
 
 
453 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.8 
 
 
466 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  45.5 
 
 
438 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  45.5 
 
 
438 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.3 
 
 
438 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  45.5 
 
 
434 aa  322  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  45.5 
 
 
434 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  47.13 
 
 
434 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  44.16 
 
 
440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  45.73 
 
 
438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.47 
 
 
447 aa  320  3e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.24 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  44.66 
 
 
442 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  43.97 
 
 
443 aa  319  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.63 
 
 
439 aa  319  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  43.92 
 
 
466 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  42.76 
 
 
435 aa  318  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.92 
 
 
466 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.92 
 
 
466 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.92 
 
 
466 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.69 
 
 
472 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.57 
 
 
436 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  42.99 
 
 
470 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.51 
 
 
473 aa  316  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.99 
 
 
467 aa  316  5e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.19 
 
 
473 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  43.06 
 
 
437 aa  316  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.33 
 
 
460 aa  316  6e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.96 
 
 
473 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  43.06 
 
 
437 aa  316  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  44.32 
 
 
473 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  44.42 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.24 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  44.04 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  43.35 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.09 
 
 
478 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.35 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.88 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.88 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.99 
 
 
450 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.35 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  43.28 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  46.57 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.35 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  44.57 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.81 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.28 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  42.5 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  42.66 
 
 
482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 
463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  43.49 
 
 
466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  41.81 
 
 
438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  46.57 
 
 
435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  43.34 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  43.2 
 
 
442 aa  312  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  44.15 
 
 
434 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.3 
 
 
466 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  44.15 
 
 
434 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.95 
 
 
457 aa  312  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.03 
 
 
456 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.43 
 
 
482 aa  312  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  44.6 
 
 
440 aa  311  1e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.89 
 
 
466 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.01 
 
 
462 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.01 
 
 
441 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  43.35 
 
 
470 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.53 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.89 
 
 
466 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.11 
 
 
438 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>