More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1141 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
432 aa  859    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  70.97 
 
 
431 aa  584  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  62.36 
 
 
429 aa  538  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  53.97 
 
 
486 aa  473  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.49 
 
 
431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.44 
 
 
421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.24 
 
 
425 aa  404  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.52 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.08 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.57 
 
 
425 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.49 
 
 
459 aa  332  9e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  39.74 
 
 
451 aa  328  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  41.59 
 
 
459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  40.52 
 
 
427 aa  319  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
443 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  43.22 
 
 
431 aa  316  6e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  39.59 
 
 
446 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  40.14 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1120  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.47 
 
 
309 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.76 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  39.63 
 
 
443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  41.19 
 
 
427 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  41.03 
 
 
438 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  43.19 
 
 
433 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.59 
 
 
445 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.93 
 
 
438 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  41.23 
 
 
453 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  40.92 
 
 
453 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.32 
 
 
472 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  41.86 
 
 
434 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.86 
 
 
438 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  41.86 
 
 
438 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.63 
 
 
438 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  41.86 
 
 
438 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  41.86 
 
 
434 aa  296  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.5 
 
 
503 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  40.42 
 
 
445 aa  295  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.01 
 
 
424 aa  295  1e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.86 
 
 
460 aa  295  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.46 
 
 
440 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.33 
 
 
439 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  37.1 
 
 
438 aa  294  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.14 
 
 
434 aa  293  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  39.49 
 
 
445 aa  293  5e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40 
 
 
447 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.53 
 
 
463 aa  292  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  38.32 
 
 
440 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.32 
 
 
457 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.86 
 
 
442 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  39.49 
 
 
442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.27 
 
 
445 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  39.55 
 
 
436 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3190  nucleotide sugar dehydrogenase  38.79 
 
 
453 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 
438 aa  289  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.46 
 
 
448 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.27 
 
 
467 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.54 
 
 
442 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  40.59 
 
 
458 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.81 
 
 
467 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.14 
 
 
433 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.27 
 
 
404 aa  287  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.47 
 
 
442 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  38.46 
 
 
475 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.14 
 
 
447 aa  286  5e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
437 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  39.78 
 
 
447 aa  285  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  37.42 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  38.21 
 
 
440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.95 
 
 
436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  36.67 
 
 
435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.29 
 
 
436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.22 
 
 
440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.41 
 
 
456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  39.41 
 
 
441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.36 
 
 
462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.37 
 
 
440 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.37 
 
 
440 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39 
 
 
437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.96 
 
 
443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.23 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.58 
 
 
462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  39.59 
 
 
437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.95 
 
 
456 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.89 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.8 
 
 
452 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.36 
 
 
453 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  38.88 
 
 
522 aa  282  7.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.91 
 
 
436 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  38.22 
 
 
449 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  38.22 
 
 
449 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  38.88 
 
 
449 aa  282  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.53 
 
 
450 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.07 
 
 
453 aa  282  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.07 
 
 
462 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.07 
 
 
462 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.07 
 
 
456 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.07 
 
 
441 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  40.24 
 
 
456 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  39.01 
 
 
450 aa  282  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  36.91 
 
 
467 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>