More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2846 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
489 aa  1000    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  51.32 
 
 
475 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  48.27 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  46.25 
 
 
463 aa  415  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  48.27 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  46.17 
 
 
457 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  46.12 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.51 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.15 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.51 
 
 
471 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.85 
 
 
459 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.4 
 
 
404 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.73 
 
 
443 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  41.74 
 
 
427 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  43.04 
 
 
453 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  43.04 
 
 
453 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.08 
 
 
434 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  42.04 
 
 
446 aa  359  7e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.76 
 
 
438 aa  359  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.63 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.17 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.49 
 
 
436 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.56 
 
 
472 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  42.07 
 
 
437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  44.27 
 
 
436 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  41.85 
 
 
437 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  43.01 
 
 
435 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  44.05 
 
 
435 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 
460 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  40.53 
 
 
440 aa  349  5e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.89 
 
 
433 aa  349  7e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.52 
 
 
453 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.17 
 
 
438 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 
436 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.89 
 
 
435 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  41.89 
 
 
436 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.39 
 
 
436 aa  346  6e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0973  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.98 
 
 
390 aa  345  8.999999999999999e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00533761  normal  0.376368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.98 
 
 
434 aa  345  8.999999999999999e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41 
 
 
439 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  39.6 
 
 
449 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.01 
 
 
440 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  41.01 
 
 
459 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.54 
 
 
447 aa  342  5.999999999999999e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 
440 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  42.2 
 
 
441 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.61 
 
 
456 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.9 
 
 
445 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  40.66 
 
 
438 aa  342  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.56 
 
 
451 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.23 
 
 
436 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 
436 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.67 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  44.21 
 
 
447 aa  340  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.69 
 
 
450 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  42.52 
 
 
439 aa  340  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.7 
 
 
462 aa  340  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  40.52 
 
 
440 aa  339  5e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.63 
 
 
437 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  41.98 
 
 
442 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  38.99 
 
 
438 aa  338  9e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.48 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.48 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.61 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.79 
 
 
478 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  42.64 
 
 
456 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.22 
 
 
462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.7 
 
 
456 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  41.52 
 
 
449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.39 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.75 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.43 
 
 
450 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.79 
 
 
433 aa  336  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3190  nucleotide sugar dehydrogenase  40.91 
 
 
453 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.35 
 
 
448 aa  336  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  41.87 
 
 
450 aa  336  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.32 
 
 
434 aa  336  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  42.08 
 
 
434 aa  335  7.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.39 
 
 
453 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
467 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  42.08 
 
 
434 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  41.89 
 
 
435 aa  335  1e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  40.13 
 
 
443 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  40.6 
 
 
447 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.58 
 
 
447 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  42.32 
 
 
434 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.87 
 
 
450 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.77 
 
 
457 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.7 
 
 
434 aa  333  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.57 
 
 
440 aa  333  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  42.16 
 
 
470 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  39.96 
 
 
440 aa  332  7.000000000000001e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.61 
 
 
456 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.63 
 
 
440 aa  332  8e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.63 
 
 
440 aa  332  8e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  40.17 
 
 
445 aa  332  8e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4084  nucleotide sugar dehydrogenase  40.22 
 
 
458 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  41.67 
 
 
445 aa  332  9e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.32 
 
 
434 aa  332  9e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  39.44 
 
 
450 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>