More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0952 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
404 aa  816    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  57.85 
 
 
475 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.55 
 
 
467 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  50.4 
 
 
489 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  51.06 
 
 
449 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  51.06 
 
 
449 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  49.23 
 
 
464 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53 
 
 
459 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.35 
 
 
440 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  48.18 
 
 
427 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  48.57 
 
 
457 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  49.23 
 
 
463 aa  362  5.0000000000000005e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.15 
 
 
462 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.2 
 
 
471 aa  360  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.77 
 
 
434 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.15 
 
 
451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.62 
 
 
434 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  49.21 
 
 
449 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  43.21 
 
 
440 aa  344  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.36 
 
 
438 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  48.57 
 
 
440 aa  343  5e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.39 
 
 
438 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.95 
 
 
443 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  50.65 
 
 
440 aa  342  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.67 
 
 
438 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  49.75 
 
 
439 aa  339  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.39 
 
 
436 aa  338  7e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.86 
 
 
472 aa  338  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  46.51 
 
 
440 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.54 
 
 
434 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.54 
 
 
434 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.72 
 
 
463 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.9 
 
 
434 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.18 
 
 
436 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  48.03 
 
 
445 aa  334  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  49.22 
 
 
446 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.23 
 
 
437 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.97 
 
 
439 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  47.01 
 
 
522 aa  331  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.15 
 
 
440 aa  331  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.15 
 
 
440 aa  331  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  49.08 
 
 
448 aa  330  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  45.26 
 
 
438 aa  331  2e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.45 
 
 
433 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.09 
 
 
433 aa  330  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  47.04 
 
 
434 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  48.46 
 
 
435 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.7 
 
 
438 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  49.87 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.76 
 
 
457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  48.76 
 
 
456 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.18 
 
 
460 aa  328  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  49.23 
 
 
434 aa  329  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  49.35 
 
 
447 aa  329  7e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  45.16 
 
 
458 aa  328  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  47.04 
 
 
434 aa  328  9e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.03 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  44.13 
 
 
443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  49.36 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.48 
 
 
448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  51.44 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.29 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  47.81 
 
 
467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  49.23 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  47.98 
 
 
464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  45.97 
 
 
442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  49.61 
 
 
434 aa  325  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  48.04 
 
 
450 aa  326  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.08 
 
 
437 aa  325  8.000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.16 
 
 
436 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.91 
 
 
438 aa  325  9e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  45.11 
 
 
449 aa  325  9e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  49.1 
 
 
438 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.79 
 
 
435 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  47.27 
 
 
448 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  48.01 
 
 
443 aa  324  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  49.1 
 
 
452 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  49.1 
 
 
438 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.89 
 
 
444 aa  324  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.48 
 
 
442 aa  324  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.45 
 
 
452 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  48.31 
 
 
436 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.72 
 
 
440 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.37 
 
 
450 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  48.47 
 
 
437 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.35 
 
 
445 aa  322  5e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  48.47 
 
 
437 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4084  nucleotide sugar dehydrogenase  46.17 
 
 
458 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  43.58 
 
 
438 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.3 
 
 
467 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.03 
 
 
446 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  44.88 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  48.59 
 
 
463 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.29 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.69 
 
 
482 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  46.51 
 
 
445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.21 
 
 
466 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  47.52 
 
 
453 aa  319  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.6 
 
 
450 aa  319  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.81 
 
 
437 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>