More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2477 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  74.68 
 
 		 462 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  76.87 
 
 		 449 aa  737    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  75.16 
 
 		 463 aa  735    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  73.96 
 
 		 457 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  76.87 
 
 		 449 aa  737    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 471 aa  965    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  74.78 
 
 		 464 aa  724    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0973  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.69 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00533761  normal  0.376368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  52.28 
 
 		 475 aa  489  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.86 
 
 		 459 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.16 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  47.46 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  47.46 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  47.59 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.49 
 
 		 440 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.96 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  45.32 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.4 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.83 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  47.26 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.29 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.74 
 
 		 467 aa  405  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  45.95 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  46.29 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.87 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.2 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.9 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  45.2 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  45.53 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  47.15 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  46.71 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  44.57 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  47.37 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.97 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  45.2 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  44.51 
 
 		 489 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.39 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.29 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  45.99 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.59 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  46.27 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.29 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.41 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.55 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  44.76 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  44.83 
 
 		 437 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  46.27 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  44.83 
 
 		 437 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  45.05 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  46.27 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  45.39 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.43 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  45.2 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.88 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  43.01 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.59 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  44.54 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  44.86 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  45.83 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.86 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  45.81 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  45.18 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  46.02 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.56 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  46.14 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.63 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  44.78 
 
 		 454 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.45 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  43.83 
 
 		 470 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.4 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.4 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.83 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  44.13 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  44.13 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.9 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.34 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  45.83 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  44.04 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  45.95 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  43.98 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.51 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  43.83 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.83 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  43.98 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  44.25 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.83 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  43.51 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.47 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.7 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.73 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  43.89 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.73 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.5 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.08 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.47 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.47 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.67 
 
 		 447 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  45.73 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.95 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.17 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>