More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5547 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  79.18 
 
 		 482 aa  756    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.34 
 
 		 457 aa  688    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  96.81 
 
 		 470 aa  935    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.41 
 
 		 466 aa  703    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  73.89 
 
 		 454 aa  682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  77.41 
 
 		 466 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.41 
 
 		 466 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.99 
 
 		 457 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  81.82 
 
 		 476 aa  766    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.63 
 
 		 466 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  86.96 
 
 		 473 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.32 
 
 		 466 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  96.81 
 
 		 470 aa  931    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  71.68 
 
 		 453 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  78.51 
 
 		 467 aa  736    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88.44 
 
 		 473 aa  824    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.85 
 
 		 466 aa  709    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.85 
 
 		 466 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.47 
 
 		 454 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  78.51 
 
 		 467 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  79.22 
 
 		 482 aa  755    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.96 
 
 		 457 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.11 
 
 		 473 aa  826    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  70.13 
 
 		 454 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  76.97 
 
 		 466 aa  710    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.75 
 
 		 457 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  99.57 
 
 		 470 aa  955    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.96 
 
 		 473 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  73.62 
 
 		 470 aa  711    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.54 
 
 		 466 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  96.81 
 
 		 470 aa  935    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.41 
 
 		 466 aa  703    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  76.54 
 
 		 466 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  95.18 
 
 		 470 aa  897    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  74.12 
 
 		 454 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.75 
 
 		 466 aa  708    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 470 aa  957    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.54 
 
 		 466 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  96.81 
 
 		 470 aa  935    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.41 
 
 		 466 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.85 
 
 		 466 aa  720    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  66.15 
 
 		 440 aa  612  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.2 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.04 
 
 		 439 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  64.38 
 
 		 440 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.2 
 
 		 448 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.53 
 
 		 442 aa  571  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.98 
 
 		 447 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  60.31 
 
 		 447 aa  557  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  58 
 
 		 440 aa  555  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  58.63 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  59.65 
 
 		 443 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.63 
 
 		 463 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  58.85 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  60.35 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  60.83 
 
 		 449 aa  545  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.25 
 
 		 446 aa  542  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.56 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  58.02 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.84 
 
 		 440 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.24 
 
 		 450 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.3 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  58.02 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.64 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.65 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  57.87 
 
 		 448 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  58.5 
 
 		 448 aa  531  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  57.87 
 
 		 448 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  60.04 
 
 		 440 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  57.87 
 
 		 448 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.39 
 
 		 450 aa  531  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  57.43 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  57.6 
 
 		 450 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  57.21 
 
 		 450 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.87 
 
 		 467 aa  527  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.1 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  57.55 
 
 		 450 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.07 
 
 		 445 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.1 
 
 		 452 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.48 
 
 		 453 aa  521  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  58.06 
 
 		 446 aa  521  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.52 
 
 		 440 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.31 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.51 
 
 		 445 aa  518  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  56.43 
 
 		 451 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.06 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.73 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  56.17 
 
 		 446 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.97 
 
 		 446 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.8 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  55.21 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  54.63 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.92 
 
 		 452 aa  501  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  54.32 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.21 
 
 		 458 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  55.75 
 
 		 441 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.97 
 
 		 459 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  54.32 
 
 		 450 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>