More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2116 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  889    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.97 
 
 		 436 aa  626  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  71.82 
 
 		 434 aa  621  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  70.44 
 
 		 438 aa  618  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  70.05 
 
 		 440 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  70.9 
 
 		 438 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  71.13 
 
 		 434 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  71.13 
 
 		 434 aa  618  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  70.9 
 
 		 438 aa  620  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.35 
 
 		 438 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  69.35 
 
 		 439 aa  617  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  67.44 
 
 		 442 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  67.44 
 
 		 441 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  70.21 
 
 		 433 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.35 
 
 		 437 aa  608  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  70.11 
 
 		 435 aa  608  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  68.72 
 
 		 447 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  67.74 
 
 		 456 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  67.51 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  68.66 
 
 		 463 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  67.28 
 
 		 434 aa  594  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.67 
 
 		 434 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.28 
 
 		 436 aa  591  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.83 
 
 		 439 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  68.05 
 
 		 452 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.59 
 
 		 438 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  66.82 
 
 		 436 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.29 
 
 		 438 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.2 
 
 		 435 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.97 
 
 		 436 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.37 
 
 		 434 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  64.71 
 
 		 449 aa  571  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.37 
 
 		 434 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.44 
 
 		 434 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.55 
 
 		 438 aa  568  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.91 
 
 		 433 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.59 
 
 		 433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.67 
 
 		 436 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  63.53 
 
 		 464 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.22 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.38 
 
 		 434 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  61 
 
 		 441 aa  538  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.96 
 
 		 451 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.3 
 
 		 434 aa  531  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.42 
 
 		 460 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.92 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.38 
 
 		 474 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.61 
 
 		 474 aa  501  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.23 
 
 		 440 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.31 
 
 		 453 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.45 
 
 		 460 aa  488  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.41 
 
 		 443 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.45 
 
 		 436 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.15 
 
 		 438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  52.28 
 
 		 448 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  50.11 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  53.9 
 
 		 473 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.67 
 
 		 467 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.66 
 
 		 440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.66 
 
 		 440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.66 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  50.68 
 
 		 437 aa  441  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  50.68 
 
 		 437 aa  441  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  51.47 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  51.69 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  50.68 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.68 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.23 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  49.77 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.11 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  50.68 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  50.57 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  50.12 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  50.46 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  50.91 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.56 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.97 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  50.34 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  48.07 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.52 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  50.34 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  49.44 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  50.58 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  52.06 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  49.1 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  49.44 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  48.66 
 
 		 451 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.43 
 
 		 444 aa  428  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  52.06 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  50.68 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  48.24 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  48.98 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.68 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.66 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.53 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.25 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.77 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  48.68 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.23 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.21 
 
 		 452 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>