More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3767 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
473 aa  957    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88.75 
 
 
467 aa  828    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.9 
 
 
438 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  56.91 
 
 
433 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  57.14 
 
 
434 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  56.78 
 
 
438 aa  461  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  56.91 
 
 
434 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  56.78 
 
 
438 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.56 
 
 
434 aa  461  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  55.73 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  55.61 
 
 
456 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  56.31 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.18 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.21 
 
 
438 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  56.21 
 
 
434 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.79 
 
 
434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.79 
 
 
434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  54.77 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.1 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.44 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.1 
 
 
438 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.1 
 
 
434 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.42 
 
 
436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.63 
 
 
437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.09 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  54.48 
 
 
436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  50.97 
 
 
464 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  55.28 
 
 
463 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.33 
 
 
439 aa  445  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  52.29 
 
 
434 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.71 
 
 
435 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  51.52 
 
 
441 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  51.05 
 
 
442 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  52.06 
 
 
434 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.79 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  52.5 
 
 
439 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.52 
 
 
438 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.84 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  54.94 
 
 
452 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.29 
 
 
433 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.9 
 
 
438 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  51.15 
 
 
435 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.18 
 
 
433 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.9 
 
 
451 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  50.23 
 
 
449 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.83 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.11 
 
 
443 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  51.01 
 
 
441 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.7 
 
 
478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.34 
 
 
474 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.57 
 
 
474 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.39 
 
 
460 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.22 
 
 
440 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.31 
 
 
440 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.31 
 
 
440 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.45 
 
 
460 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.61 
 
 
457 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  45.3 
 
 
454 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.3 
 
 
462 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  45.51 
 
 
454 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  47.81 
 
 
453 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  45.5 
 
 
446 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  44.52 
 
 
435 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  43.74 
 
 
457 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  44.93 
 
 
449 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  44.93 
 
 
449 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.55 
 
 
453 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  42.92 
 
 
437 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  43.02 
 
 
440 aa  379  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  42.92 
 
 
437 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  46.07 
 
 
466 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  45.93 
 
 
454 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.71 
 
 
466 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  46.71 
 
 
466 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.71 
 
 
466 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  45.13 
 
 
470 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  45.99 
 
 
522 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.38 
 
 
436 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.64 
 
 
450 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  44.59 
 
 
440 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  43.28 
 
 
464 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  47.14 
 
 
470 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.86 
 
 
466 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.06 
 
 
470 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.27 
 
 
450 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  46.06 
 
 
470 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.42 
 
 
467 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  46.64 
 
 
437 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  46.64 
 
 
437 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.98 
 
 
472 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.06 
 
 
470 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  45.85 
 
 
467 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.07 
 
 
466 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  42.6 
 
 
440 aa  378  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  47.16 
 
 
466 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.5 
 
 
466 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.92 
 
 
470 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.84 
 
 
445 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.06 
 
 
470 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  45.06 
 
 
463 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>