More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0712 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
438 aa  899    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  67.5 
 
 
440 aa  622  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  62.87 
 
 
440 aa  557  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.96 
 
 
445 aa  552  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  62.08 
 
 
450 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.8 
 
 
453 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.95 
 
 
450 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.05 
 
 
442 aa  536  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  58.82 
 
 
450 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  58.45 
 
 
443 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  58.6 
 
 
450 aa  525  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.73 
 
 
467 aa  518  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.77 
 
 
440 aa  521  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.77 
 
 
440 aa  521  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.94 
 
 
442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.11 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.22 
 
 
448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  55.07 
 
 
467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  56.85 
 
 
440 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  57.76 
 
 
441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  56.59 
 
 
448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.88 
 
 
450 aa  512  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  55.68 
 
 
447 aa  511  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.39 
 
 
463 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.07 
 
 
467 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.25 
 
 
447 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  55.68 
 
 
450 aa  511  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  56.66 
 
 
450 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  55.94 
 
 
440 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  57.76 
 
 
445 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.57 
 
 
447 aa  508  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  57.56 
 
 
451 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.39 
 
 
442 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.79 
 
 
457 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  56.59 
 
 
441 aa  501  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  57.31 
 
 
445 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  55.81 
 
 
439 aa  498  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.16 
 
 
445 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.36 
 
 
445 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.31 
 
 
482 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.88 
 
 
440 aa  498  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.91 
 
 
445 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.98 
 
 
452 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.79 
 
 
447 aa  494  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  56.39 
 
 
445 aa  496  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.71 
 
 
444 aa  495  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  55.25 
 
 
445 aa  496  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  55.02 
 
 
435 aa  495  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  55.3 
 
 
449 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  54.44 
 
 
482 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.99 
 
 
446 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  53.74 
 
 
470 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  57.4 
 
 
448 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.88 
 
 
440 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.52 
 
 
466 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.35 
 
 
440 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.48 
 
 
452 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.55 
 
 
457 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  55.45 
 
 
444 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.78 
 
 
470 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  53.78 
 
 
470 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  54.79 
 
 
445 aa  491  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.78 
 
 
470 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  53.33 
 
 
476 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.33 
 
 
470 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  53.44 
 
 
453 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.9 
 
 
457 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.88 
 
 
446 aa  485  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  53.33 
 
 
470 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  53.23 
 
 
454 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  54.55 
 
 
445 aa  485  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.56 
 
 
470 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  53.33 
 
 
470 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  55.24 
 
 
522 aa  484  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  53.86 
 
 
448 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.79 
 
 
438 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  53.86 
 
 
445 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  52.78 
 
 
454 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  53.86 
 
 
448 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  53.86 
 
 
448 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.55 
 
 
457 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  52.28 
 
 
446 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  53.88 
 
 
435 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  53.3 
 
 
466 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.08 
 
 
446 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  53.65 
 
 
436 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.56 
 
 
473 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.42 
 
 
436 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  52.86 
 
 
466 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  54.77 
 
 
443 aa  478  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.55 
 
 
454 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.74 
 
 
466 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  53.53 
 
 
440 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  52.77 
 
 
454 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.05 
 
 
446 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  53.42 
 
 
437 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  52.64 
 
 
466 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  52.89 
 
 
473 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.19 
 
 
466 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.89 
 
 
473 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>