More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4414 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  82.14 
 
 
474 aa  734    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  82.37 
 
 
474 aa  735    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
478 aa  963    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.53 
 
 
436 aa  551  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  62.47 
 
 
440 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.98 
 
 
436 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 
438 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  61.43 
 
 
434 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  57.01 
 
 
441 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  61.66 
 
 
434 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  57.51 
 
 
442 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.84 
 
 
436 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60 
 
 
439 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  62.67 
 
 
436 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  61.2 
 
 
438 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  58.99 
 
 
439 aa  521  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  61.43 
 
 
434 aa  525  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  60.44 
 
 
463 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  60.14 
 
 
434 aa  524  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  61.2 
 
 
438 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  60.97 
 
 
438 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  60.28 
 
 
433 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  62.59 
 
 
452 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  60.46 
 
 
435 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  59.68 
 
 
434 aa  520  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.81 
 
 
437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.45 
 
 
433 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  58.9 
 
 
447 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.92 
 
 
435 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.99 
 
 
434 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.91 
 
 
438 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  59.68 
 
 
436 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.08 
 
 
438 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.99 
 
 
433 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.92 
 
 
438 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  59.54 
 
 
456 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.93 
 
 
434 aa  491  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.23 
 
 
451 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.97 
 
 
434 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.97 
 
 
434 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.5 
 
 
434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  54.18 
 
 
449 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.61 
 
 
437 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.08 
 
 
438 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.25 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  55.74 
 
 
464 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  53.17 
 
 
441 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.09 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.23 
 
 
453 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.54 
 
 
443 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  51.7 
 
 
473 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.21 
 
 
467 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.83 
 
 
438 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.73 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.71 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  48.67 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.92 
 
 
438 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  47.51 
 
 
442 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  46.91 
 
 
437 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  46.67 
 
 
438 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  51.26 
 
 
437 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  46.91 
 
 
437 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  51.26 
 
 
437 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  47.74 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.75 
 
 
457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.2 
 
 
436 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  46.61 
 
 
440 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  46.9 
 
 
443 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  48.86 
 
 
448 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  47.4 
 
 
466 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.03 
 
 
503 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  46.06 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.66 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  49.89 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  49.89 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.3 
 
 
442 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.47 
 
 
445 aa  395  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  48.32 
 
 
447 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  46.67 
 
 
459 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  47.43 
 
 
427 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  45.08 
 
 
435 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.1 
 
 
453 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  45.48 
 
 
443 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  43.99 
 
 
440 aa  392  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  45.86 
 
 
445 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  47.09 
 
 
441 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.86 
 
 
447 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  46.48 
 
 
449 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  46.47 
 
 
440 aa  392  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  46.48 
 
 
449 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  45.32 
 
 
457 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.34 
 
 
437 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  46.26 
 
 
445 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.15 
 
 
457 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.37 
 
 
457 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  46.37 
 
 
454 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.17 
 
 
445 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  46.36 
 
 
438 aa  386  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.85 
 
 
450 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.58 
 
 
445 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>