More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0545 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 474 aa  955    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  99.79 
 
 		 474 aa  953    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  82.14 
 
 		 478 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  61.84 
 
 		 440 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.52 
 
 		 436 aa  539  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.64 
 
 		 436 aa  531  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.45 
 
 		 438 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.08 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  60.69 
 
 		 436 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  60.92 
 
 		 463 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.36 
 
 		 438 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.37 
 
 		 436 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.29 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  59.68 
 
 		 436 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  59.31 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  55.89 
 
 		 441 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  55.89 
 
 		 442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.6 
 
 		 435 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  59.54 
 
 		 435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.53 
 
 		 439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  61.2 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  58.54 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  59.08 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  59.54 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  59.5 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.26 
 
 		 437 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  59.08 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  58.89 
 
 		 433 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.91 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  58.96 
 
 		 438 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  58.96 
 
 		 438 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  59.54 
 
 		 434 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.38 
 
 		 438 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  58.68 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.7 
 
 		 438 aa  500  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  55.97 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.48 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.16 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.71 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.71 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.56 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.82 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  55.4 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  53.29 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.56 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.94 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  51.02 
 
 		 441 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.23 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.95 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.64 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.82 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  50.34 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.34 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  47.13 
 
 		 438 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  47.07 
 
 		 442 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  47.36 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.32 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  48.3 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  47.36 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.14 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  49.54 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  47.17 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  49.32 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  49.54 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.54 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  47.36 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  47.1 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  47.48 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.89 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.86 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.43 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.09 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.91 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  46.74 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  49.32 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  49.32 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.09 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  46.38 
 
 		 440 aa  398  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  46.94 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  47.31 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  45.43 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.74 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  45.61 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.04 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  46.26 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  44.96 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  44.74 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.76 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  46.73 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  46.31 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.86 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.8 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  44.98 
 
 		 437 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.55 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.28 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  45.25 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  45.8 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.35 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  43.54 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>