More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2536 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
427 aa  870    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.27 
 
 
460 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.92 
 
 
443 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.21 
 
 
438 aa  450  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  50.23 
 
 
446 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.03 
 
 
440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.54 
 
 
451 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.3 
 
 
438 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.88 
 
 
436 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  48.21 
 
 
449 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.12 
 
 
434 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  48.21 
 
 
449 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.75 
 
 
450 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  50 
 
 
459 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  48.96 
 
 
442 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  51.09 
 
 
443 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  47.22 
 
 
435 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.12 
 
 
438 aa  425  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  49.53 
 
 
436 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.13 
 
 
438 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  48.83 
 
 
439 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  46.14 
 
 
475 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  48.84 
 
 
435 aa  422  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  48.23 
 
 
449 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.18 
 
 
450 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.6 
 
 
436 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.73 
 
 
437 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 
434 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  48.49 
 
 
434 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  47.6 
 
 
466 aa  421  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.7 
 
 
453 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  47.32 
 
 
443 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  48.59 
 
 
437 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  47.89 
 
 
437 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.65 
 
 
436 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  49.43 
 
 
440 aa  419  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  48.59 
 
 
437 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.14 
 
 
436 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  46.84 
 
 
456 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  46.42 
 
 
464 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  47.8 
 
 
433 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  48.26 
 
 
441 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.46 
 
 
471 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  48.26 
 
 
434 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  47.1 
 
 
440 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.91 
 
 
439 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.1 
 
 
462 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  47.1 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.13 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.8 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  47.43 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  44.27 
 
 
457 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  47.33 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  47.1 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.02 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  45.43 
 
 
463 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.66 
 
 
439 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.9 
 
 
434 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  44.16 
 
 
437 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  45.35 
 
 
467 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.9 
 
 
434 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  46.39 
 
 
442 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  48.5 
 
 
448 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.63 
 
 
436 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.77 
 
 
448 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.35 
 
 
467 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  46.53 
 
 
447 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  47.66 
 
 
434 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  47.1 
 
 
453 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  44.86 
 
 
436 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47 
 
 
440 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47 
 
 
440 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  46.64 
 
 
438 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  44.16 
 
 
437 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  44.63 
 
 
435 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  47.62 
 
 
522 aa  408  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.8 
 
 
451 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.36 
 
 
434 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  46.7 
 
 
451 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.91 
 
 
452 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  47.25 
 
 
445 aa  409  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  45.22 
 
 
438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.29 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.06 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.71 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.06 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.71 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.06 
 
 
456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  47.59 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.64 
 
 
457 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  43.94 
 
 
441 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  45.43 
 
 
445 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  45.19 
 
 
454 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  45.41 
 
 
454 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.08 
 
 
445 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  46.1 
 
 
445 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 
456 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  45.66 
 
 
450 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  46 
 
 
440 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.31 
 
 
442 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>