More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1130 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
453 aa  930    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  51.21 
 
 
446 aa  487  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  47.92 
 
 
459 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  47.1 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  46.53 
 
 
434 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  46.53 
 
 
434 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.74 
 
 
436 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  48.51 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.1 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  48.05 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  48.51 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  48.63 
 
 
447 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  45.96 
 
 
466 aa  398  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  46.71 
 
 
441 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.82 
 
 
445 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  44.9 
 
 
440 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  47.99 
 
 
456 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  49.31 
 
 
435 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  45.35 
 
 
444 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  47.05 
 
 
440 aa  392  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  45.96 
 
 
437 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.54 
 
 
438 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  44.7 
 
 
438 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  45.96 
 
 
437 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  47.52 
 
 
445 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.55 
 
 
460 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.14 
 
 
471 aa  388  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  45.8 
 
 
445 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  47.36 
 
 
439 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  45.18 
 
 
475 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  45.27 
 
 
457 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  46.68 
 
 
454 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.6 
 
 
451 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47 
 
 
436 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  48.51 
 
 
463 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.94 
 
 
440 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.79 
 
 
438 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.12 
 
 
445 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.1 
 
 
457 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  46.34 
 
 
453 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  44.27 
 
 
435 aa  382  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  48.05 
 
 
434 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.43 
 
 
462 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.77 
 
 
434 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  47.64 
 
 
452 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  44.67 
 
 
445 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.22 
 
 
434 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.9 
 
 
438 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.06 
 
 
436 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  47.7 
 
 
438 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.58 
 
 
457 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  48.28 
 
 
434 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.85 
 
 
438 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  46.58 
 
 
454 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  47.03 
 
 
445 aa  382  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  47.7 
 
 
438 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  47.13 
 
 
433 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  47.47 
 
 
438 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  45.5 
 
 
443 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.66 
 
 
442 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  46.54 
 
 
441 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.35 
 
 
450 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.1 
 
 
442 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.72 
 
 
451 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.92 
 
 
456 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.65 
 
 
439 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  47.59 
 
 
434 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.15 
 
 
467 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  45.64 
 
 
449 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  46.54 
 
 
442 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.05 
 
 
444 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  45.64 
 
 
449 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  46.07 
 
 
445 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  44.92 
 
 
450 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.25 
 
 
459 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  46.14 
 
 
445 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.75 
 
 
438 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  44.52 
 
 
440 aa  380  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.92 
 
 
456 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  46.08 
 
 
436 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.47 
 
 
433 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  44.06 
 
 
464 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  44.25 
 
 
463 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  46.54 
 
 
434 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  46.61 
 
 
445 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.92 
 
 
450 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  45.33 
 
 
441 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  47.24 
 
 
436 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.37 
 
 
433 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.54 
 
 
440 aa  376  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.54 
 
 
440 aa  376  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.1 
 
 
436 aa  378  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  46.42 
 
 
442 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.38 
 
 
445 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.47 
 
 
473 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.67 
 
 
452 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  45.02 
 
 
449 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.28 
 
 
447 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.99 
 
 
462 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.22 
 
 
456 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>