More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0769 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  100 
 
 
434 aa  890    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
434 aa  890    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  49.42 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  45.81 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  46.31 
 
 
453 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  44.32 
 
 
459 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.93 
 
 
438 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.06 
 
 
436 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  45.85 
 
 
440 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.45 
 
 
443 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.68 
 
 
472 aa  359  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.37 
 
 
438 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.06 
 
 
433 aa  358  8e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.14 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.91 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  41.48 
 
 
457 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.7 
 
 
434 aa  355  7.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.56 
 
 
442 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.32 
 
 
440 aa  354  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.32 
 
 
440 aa  354  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.21 
 
 
438 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  42.09 
 
 
449 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  42.09 
 
 
449 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  42.56 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  44.29 
 
 
522 aa  353  4e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  44.42 
 
 
466 aa  353  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  40.52 
 
 
464 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  44.04 
 
 
450 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  43.98 
 
 
442 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.6 
 
 
439 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  44.91 
 
 
440 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  45.27 
 
 
438 aa  350  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  43.75 
 
 
441 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.52 
 
 
439 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.28 
 
 
440 aa  349  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  45.5 
 
 
438 aa  349  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  45.5 
 
 
438 aa  349  6e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  45.6 
 
 
436 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.57 
 
 
440 aa  348  8e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  46.37 
 
 
431 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.26 
 
 
462 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.58 
 
 
436 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  45.81 
 
 
435 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  46.3 
 
 
434 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  45.81 
 
 
436 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.48 
 
 
445 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  45.52 
 
 
433 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  45.6 
 
 
434 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.42 
 
 
438 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.68 
 
 
436 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.86 
 
 
448 aa  345  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.93 
 
 
436 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.36 
 
 
466 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  43.12 
 
 
448 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  43.12 
 
 
448 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  45.37 
 
 
434 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  43.12 
 
 
448 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  42.2 
 
 
447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  40.52 
 
 
443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  44.91 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  43.61 
 
 
441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.74 
 
 
460 aa  343  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.35 
 
 
445 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.98 
 
 
434 aa  343  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.89 
 
 
442 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.76 
 
 
451 aa  342  9e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  43.72 
 
 
427 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.62 
 
 
478 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  41.76 
 
 
437 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  44.27 
 
 
447 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  41.76 
 
 
437 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 
445 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  40.43 
 
 
463 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  45.27 
 
 
452 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.08 
 
 
439 aa  341  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.34 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.01 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.66 
 
 
447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  42.36 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  42.26 
 
 
442 aa  340  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  42.49 
 
 
438 aa  339  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  43.25 
 
 
443 aa  339  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  42.53 
 
 
445 aa  339  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.44 
 
 
457 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.89 
 
 
444 aa  339  7e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  42.66 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  43.75 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  40.88 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.91 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  44.21 
 
 
439 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.38 
 
 
471 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.02 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  42.76 
 
 
467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  43.22 
 
 
440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  42.32 
 
 
470 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.07 
 
 
445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  42.82 
 
 
434 aa  336  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  42.92 
 
 
437 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.76 
 
 
467 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  42.92 
 
 
437 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>