More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0408 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
439 aa  872    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  69.48 
 
 
437 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.06 
 
 
439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.48 
 
 
442 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  66.59 
 
 
443 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.8 
 
 
442 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.8 
 
 
442 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  66.97 
 
 
439 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.07 
 
 
446 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.84 
 
 
444 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.58 
 
 
547 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.21 
 
 
456 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.6 
 
 
462 aa  535  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  65.29 
 
 
443 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  62.93 
 
 
494 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  62.24 
 
 
437 aa  529  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.9 
 
 
490 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  62.33 
 
 
443 aa  526  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  62.5 
 
 
434 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  61.87 
 
 
438 aa  521  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  61.28 
 
 
439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.56 
 
 
475 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.29 
 
 
495 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.91 
 
 
440 aa  514  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  59.32 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.22 
 
 
475 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.33 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  57.11 
 
 
440 aa  501  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  61.73 
 
 
439 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.26 
 
 
440 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.77 
 
 
437 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.26 
 
 
440 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  63.7 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.36 
 
 
465 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  59.31 
 
 
477 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  57.93 
 
 
452 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  55.01 
 
 
474 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.08 
 
 
488 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  57.68 
 
 
494 aa  458  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.59 
 
 
454 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.72 
 
 
438 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.23 
 
 
441 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.85 
 
 
438 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  54.07 
 
 
434 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.06 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.04 
 
 
434 aa  356  5e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.41 
 
 
438 aa  352  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  43.71 
 
 
459 aa  349  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  44.95 
 
 
463 aa  346  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.83 
 
 
434 aa  346  6e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  43.95 
 
 
447 aa  345  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.2 
 
 
434 aa  343  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.43 
 
 
434 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.43 
 
 
434 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  43.45 
 
 
438 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  41.38 
 
 
434 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  45.08 
 
 
434 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  45.08 
 
 
434 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  43.45 
 
 
438 aa  341  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  40.83 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.43 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  41.38 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.99 
 
 
434 aa  340  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  39.44 
 
 
427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  43.58 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.99 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.58 
 
 
440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  39.22 
 
 
438 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.48 
 
 
438 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  43.68 
 
 
452 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.65 
 
 
436 aa  334  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  40.18 
 
 
437 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  40.18 
 
 
437 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.24 
 
 
443 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  37.99 
 
 
443 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  40.78 
 
 
441 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  38.44 
 
 
435 aa  331  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  42.53 
 
 
438 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.93 
 
 
451 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  41.22 
 
 
450 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  42.3 
 
 
433 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.55 
 
 
442 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  40.46 
 
 
442 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.36 
 
 
440 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.36 
 
 
440 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.31 
 
 
442 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  41.15 
 
 
439 aa  328  9e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  42.43 
 
 
464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  43.3 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  42.07 
 
 
434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.6 
 
 
434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.01 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  38.32 
 
 
440 aa  327  3e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.73 
 
 
438 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.81 
 
 
460 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.58 
 
 
436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.84 
 
 
436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.59 
 
 
440 aa  326  6e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.24 
 
 
435 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  40.46 
 
 
446 aa  325  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>