More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6546 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 490 aa  967    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.04 
 
 		 547 aa  586  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  67.74 
 
 		 443 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.91 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  67.59 
 
 		 437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.98 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  62.41 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.96 
 
 		 442 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.96 
 
 		 442 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.27 
 
 		 442 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.07 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  60.35 
 
 		 465 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.38 
 
 		 444 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.54 
 
 		 446 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  63.08 
 
 		 443 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.97 
 
 		 495 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  61.2 
 
 		 434 aa  511  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  64.29 
 
 		 443 aa  510  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.6 
 
 		 475 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  61.05 
 
 		 438 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.15 
 
 		 475 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.16 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  59.63 
 
 		 437 aa  498  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 		 439 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.38 
 
 		 462 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  59.82 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.01 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.01 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.62 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  57.99 
 
 		 452 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  53.9 
 
 		 474 aa  458  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  56.11 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  54.3 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.05 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.27 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  60.36 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  55.38 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.52 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.66 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.77 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  52.23 
 
 		 434 aa  349  8e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  38.41 
 
 		 443 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  40.96 
 
 		 443 aa  332  9e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.19 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  41.69 
 
 		 459 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  40.73 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.35 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.67 
 
 		 427 aa  322  7e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  40.18 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.05 
 
 		 438 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  38.91 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  40.81 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  38.07 
 
 		 437 aa  316  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  38.07 
 
 		 437 aa  316  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.19 
 
 		 451 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  42.17 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  39.32 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.33 
 
 		 438 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  41.99 
 
 		 440 aa  312  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.2 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 		 449 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0620  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.53 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0934466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  41.71 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  39.95 
 
 		 440 aa  309  9e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.43 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.59 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  36.67 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.81 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  42.05 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.36 
 
 		 442 aa  306  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  39.64 
 
 		 446 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.21 
 
 		 453 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.79 
 
 		 440 aa  305  8.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.79 
 
 		 440 aa  305  8.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  42.05 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  41.21 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.98 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.64 
 
 		 450 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.82 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.59 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  44.58 
 
 		 447 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.3 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  36.18 
 
 		 435 aa  302  8.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.04 
 
 		 478 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  40.68 
 
 		 456 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.86 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.08 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  37.7 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.05 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 		 464 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  41.56 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  38.72 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.06 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  39.2 
 
 		 450 aa  300  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  38.32 
 
 		 445 aa  300  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.94 
 
 		 453 aa  300  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>