More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0289 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
444 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  80.78 
 
 
443 aa  711    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  87.21 
 
 
446 aa  779    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.86 
 
 
442 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.86 
 
 
442 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.86 
 
 
442 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  68.47 
 
 
465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  68.68 
 
 
434 aa  581  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.39 
 
 
439 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.98 
 
 
456 aa  548  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  62.5 
 
 
439 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.84 
 
 
439 aa  544  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  62.93 
 
 
437 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  63.43 
 
 
439 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  60.82 
 
 
437 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  62.27 
 
 
439 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.47 
 
 
462 aa  508  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  61.42 
 
 
452 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.87 
 
 
440 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  60.18 
 
 
494 aa  505  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  62.01 
 
 
477 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  59.5 
 
 
438 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  59.04 
 
 
443 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.45 
 
 
437 aa  501  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59 
 
 
440 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.07 
 
 
490 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59 
 
 
440 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.24 
 
 
495 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  60.27 
 
 
443 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.55 
 
 
547 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.27 
 
 
488 aa  482  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59 
 
 
444 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  56.08 
 
 
440 aa  467  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.56 
 
 
475 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56 
 
 
475 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  59.36 
 
 
435 aa  455  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  52.41 
 
 
474 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.55 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  54.44 
 
 
494 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.88 
 
 
438 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.55 
 
 
454 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.02 
 
 
441 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.59 
 
 
438 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  52.23 
 
 
434 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.28 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  42.47 
 
 
442 aa  345  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  43.82 
 
 
447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  42.82 
 
 
443 aa  341  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 
433 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  41.72 
 
 
437 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  41.72 
 
 
437 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  41.23 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.21 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  41 
 
 
434 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  43.91 
 
 
434 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  43.69 
 
 
463 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  42.47 
 
 
436 aa  334  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.74 
 
 
434 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  41.53 
 
 
449 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  44.39 
 
 
434 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  44.15 
 
 
438 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  44.15 
 
 
438 aa  333  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  39.86 
 
 
443 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.24 
 
 
434 aa  332  9e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.15 
 
 
440 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.96 
 
 
442 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.86 
 
 
443 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  43.91 
 
 
434 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.41 
 
 
434 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  41.55 
 
 
439 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.89 
 
 
467 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  43.81 
 
 
446 aa  329  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  43.91 
 
 
438 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.54 
 
 
438 aa  329  7e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  40.45 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  44.39 
 
 
452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.01 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  41.19 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  38.88 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.08 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.32 
 
 
437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  42.83 
 
 
450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  42.89 
 
 
473 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  41.76 
 
 
456 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.02 
 
 
478 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  42.47 
 
 
436 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.18 
 
 
435 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.51 
 
 
436 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.33 
 
 
440 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.33 
 
 
440 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  40.77 
 
 
435 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.55 
 
 
436 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  41.14 
 
 
437 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  38.43 
 
 
427 aa  322  6e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  42.21 
 
 
441 aa  322  6e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.92 
 
 
438 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  38.86 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.6 
 
 
434 aa  322  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.89 
 
 
442 aa  319  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>