More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0598 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  80.78 
 
 
443 aa  721    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  87.21 
 
 
444 aa  779    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
446 aa  894    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.32 
 
 
442 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.72 
 
 
442 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.72 
 
 
442 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  68.34 
 
 
465 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  68.68 
 
 
434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.07 
 
 
439 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  62.98 
 
 
439 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.62 
 
 
439 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.3 
 
 
456 aa  542  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  62.24 
 
 
437 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  61.85 
 
 
439 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  61.85 
 
 
439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.59 
 
 
440 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.59 
 
 
440 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  59.23 
 
 
437 aa  510  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.16 
 
 
462 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  60.41 
 
 
438 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  60.36 
 
 
452 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.9 
 
 
547 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  59.95 
 
 
494 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  61.33 
 
 
477 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60 
 
 
437 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.27 
 
 
440 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  57.21 
 
 
443 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.82 
 
 
495 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.07 
 
 
490 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  59.82 
 
 
443 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.6 
 
 
488 aa  480  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.11 
 
 
475 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.11 
 
 
475 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.31 
 
 
444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  56.08 
 
 
440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  59.59 
 
 
435 aa  461  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  52.44 
 
 
474 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.39 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.9 
 
 
438 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  54.81 
 
 
494 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.88 
 
 
454 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.45 
 
 
441 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.96 
 
 
438 aa  363  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  50.92 
 
 
434 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.6 
 
 
451 aa  354  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  42.82 
 
 
442 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.43 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  41.46 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  41.46 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  42.63 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  43.35 
 
 
473 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  42.11 
 
 
442 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  42.56 
 
 
433 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.7 
 
 
467 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  40.14 
 
 
443 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.67 
 
 
438 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  42.11 
 
 
441 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.99 
 
 
443 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  42.76 
 
 
447 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.64 
 
 
438 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 
435 aa  330  3e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.05 
 
 
434 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
434 aa  329  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  41.32 
 
 
439 aa  329  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.41 
 
 
438 aa  329  7e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  42.83 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.82 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  41.82 
 
 
437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  41.46 
 
 
436 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  42.31 
 
 
438 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  40.41 
 
 
434 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  42.31 
 
 
438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.57 
 
 
458 aa  326  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
434 aa  325  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.19 
 
 
478 aa  325  8.000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.22 
 
 
444 aa  325  9e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  40.67 
 
 
440 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 
446 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  40.13 
 
 
448 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  40.18 
 
 
434 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
438 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.82 
 
 
440 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  43.64 
 
 
437 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  43.64 
 
 
437 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  38.65 
 
 
440 aa  323  4e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.4 
 
 
436 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 
459 aa  322  8e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  44.27 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.61 
 
 
427 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.72 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  44.27 
 
 
436 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.27 
 
 
435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.65 
 
 
446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  41.88 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.72 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.04 
 
 
436 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.88 
 
 
438 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.87 
 
 
438 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>