More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4461 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
438 aa  885    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  71.03 
 
 
439 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  72.18 
 
 
439 aa  618  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.63 
 
 
456 aa  617  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.28 
 
 
437 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.24 
 
 
439 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  61.19 
 
 
440 aa  542  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  61.87 
 
 
443 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.19 
 
 
442 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  62.33 
 
 
437 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.96 
 
 
442 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.96 
 
 
442 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  62.95 
 
 
439 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  61.64 
 
 
437 aa  524  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  64.29 
 
 
435 aa  524  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.87 
 
 
439 aa  521  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  60.73 
 
 
494 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.27 
 
 
440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.27 
 
 
440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  58.9 
 
 
465 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.41 
 
 
446 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.5 
 
 
444 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  59.68 
 
 
434 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  59.4 
 
 
443 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.51 
 
 
495 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.05 
 
 
490 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.56 
 
 
454 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.54 
 
 
440 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.49 
 
 
444 aa  487  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  55.94 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  56.16 
 
 
477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.26 
 
 
475 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  56.66 
 
 
494 aa  463  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.76 
 
 
462 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.81 
 
 
475 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  57.4 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.2 
 
 
465 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.98 
 
 
547 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.88 
 
 
488 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  50.78 
 
 
474 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  56.35 
 
 
434 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.77 
 
 
438 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.21 
 
 
441 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.37 
 
 
438 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.57 
 
 
438 aa  328  9e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.04 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.47 
 
 
438 aa  326  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  41.28 
 
 
441 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.83 
 
 
433 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  41.06 
 
 
442 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.41 
 
 
434 aa  322  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.27 
 
 
434 aa  319  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  42.11 
 
 
440 aa  319  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  40.96 
 
 
463 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  41.82 
 
 
441 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 
434 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  41.14 
 
 
439 aa  316  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.65 
 
 
437 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
443 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  40.83 
 
 
438 aa  315  9e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  40.83 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  40.64 
 
 
456 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.14 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.13 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  38.58 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.06 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  40.6 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  41.06 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.6 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.24 
 
 
427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38.9 
 
 
442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.18 
 
 
434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  40.6 
 
 
452 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  41.42 
 
 
436 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.18 
 
 
436 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  40.64 
 
 
435 aa  312  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.42 
 
 
438 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 
436 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.18 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.18 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.51 
 
 
470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  43.5 
 
 
447 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.78 
 
 
478 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.51 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.51 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  39.51 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  39.29 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.29 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.68 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  38.83 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.44 
 
 
457 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.32 
 
 
433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.96 
 
 
473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  38.46 
 
 
459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  38.81 
 
 
434 aa  306  6e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.24 
 
 
442 aa  306  6e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 
436 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  38.91 
 
 
446 aa  305  9.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.96 
 
 
473 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  38.81 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>