More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1163 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  76.96 
 
 		 452 aa  666    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 477 aa  938    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  60.23 
 
 		 439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.01 
 
 		 444 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.33 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.54 
 
 		 442 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  61.01 
 
 		 443 aa  501  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  60.09 
 
 		 437 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  56.55 
 
 		 494 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  57.08 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.56 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.31 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.55 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.78 
 
 		 440 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  56.46 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  57.7 
 
 		 437 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  56.16 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  56.16 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.61 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.61 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.79 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  57.77 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.04 
 
 		 437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  57.14 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.18 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  58.58 
 
 		 443 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.69 
 
 		 475 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.12 
 
 		 475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.47 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.72 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  53.72 
 
 		 440 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.04 
 
 		 547 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.04 
 
 		 490 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  48.68 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  57.67 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.94 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.69 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.55 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  50.67 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.21 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.37 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  50.79 
 
 		 434 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.63 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  45.64 
 
 		 473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.06 
 
 		 451 aa  352  8e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.89 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  39.68 
 
 		 443 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.4 
 
 		 462 aa  348  9e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.43 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  42.89 
 
 		 446 aa  346  5e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  43.09 
 
 		 433 aa  345  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.63 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  44.37 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 		 438 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.79 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 		 459 aa  340  5e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.4 
 
 		 434 aa  338  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.18 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.18 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.41 
 
 		 442 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.43 
 
 		 438 aa  336  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  44.37 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  38.95 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  38.24 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  42.01 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.69 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.69 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.95 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  40.38 
 
 		 463 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  42.17 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  41.38 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.91 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  41.65 
 
 		 457 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  41.38 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  43.05 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  41.94 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  43.22 
 
 		 464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  39.04 
 
 		 435 aa  329  8e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  39.74 
 
 		 454 aa  328  9e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.46 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.97 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  42.92 
 
 		 435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.37 
 
 		 446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.67 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  41.06 
 
 		 449 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  41.06 
 
 		 449 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.4 
 
 		 457 aa  326  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.32 
 
 		 442 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.65 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.78 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  41.91 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.26 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  44.14 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  42.86 
 
 		 452 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.61 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>