More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1504 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  873    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.9 
 
 		 446 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  53.1 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.38 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.6 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.88 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  51.26 
 
 		 443 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.72 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  53.53 
 
 		 443 aa  428  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  50.69 
 
 		 494 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  52.9 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.13 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  50.46 
 
 		 437 aa  418  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.52 
 
 		 490 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  52.05 
 
 		 465 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.14 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.67 
 
 		 547 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.83 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.83 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.1 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  49.77 
 
 		 438 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  46.62 
 
 		 440 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.54 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.87 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.62 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  50.69 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.65 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  48.98 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  49.1 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.79 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  49.2 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  45.86 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  47.95 
 
 		 443 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.16 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.64 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.44 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  48.76 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  48.42 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  49.09 
 
 		 435 aa  348  9e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.7 
 
 		 465 aa  338  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  41.88 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  49.21 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  41.42 
 
 		 442 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  42.56 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  44.16 
 
 		 452 aa  312  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  44.09 
 
 		 463 aa  312  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  39.23 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.71 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  38.78 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 		 438 aa  309  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0620  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.36 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0934466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.64 
 
 		 446 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.11 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  44.89 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.97 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  40.97 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  38.46 
 
 		 440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  38.76 
 
 		 443 aa  302  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.05 
 
 		 438 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  37.79 
 
 		 446 aa  302  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.96 
 
 		 459 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.65 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.14 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.14 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  36.2 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.18 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  36.96 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  36.45 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  37.39 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.91 
 
 		 440 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.26 
 
 		 434 aa  300  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.1 
 
 		 458 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.32 
 
 		 443 aa  299  7e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  37.39 
 
 		 437 aa  298  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  37.39 
 
 		 437 aa  298  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  36.49 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  40.18 
 
 		 450 aa  296  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.22 
 
 		 451 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.32 
 
 		 434 aa  295  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.01 
 
 		 450 aa  295  7e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  40.05 
 
 		 434 aa  296  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  41.42 
 
 		 456 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.28 
 
 		 445 aa  295  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.36 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  36.3 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.84 
 
 		 450 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  40.67 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.73 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.18 
 
 		 451 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  36.71 
 
 		 445 aa  294  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.5 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.18 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  37.8 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  38.1 
 
 		 440 aa  293  6e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>