More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0709 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 444 aa  882    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.25 
 
 		 495 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.84 
 
 		 465 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.33 
 
 		 439 aa  522  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  60.81 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.09 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.37 
 
 		 490 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  58.49 
 
 		 438 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  59.82 
 
 		 437 aa  498  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.22 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 		 439 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.73 
 
 		 442 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.76 
 
 		 547 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.64 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.64 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  56.43 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  59.01 
 
 		 443 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.31 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  58.45 
 
 		 494 aa  477  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  57.08 
 
 		 439 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.61 
 
 		 440 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.61 
 
 		 440 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.7 
 
 		 475 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.7 
 
 		 475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.55 
 
 		 440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  56.82 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  54.75 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.63 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  57.31 
 
 		 439 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  58.68 
 
 		 452 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  61.56 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.13 
 
 		 437 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.83 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  55.99 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  56.72 
 
 		 477 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  50.55 
 
 		 474 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.47 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  56.88 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  51.19 
 
 		 434 aa  352  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.95 
 
 		 441 aa  349  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  42.92 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.29 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.86 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  43.11 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  42.67 
 
 		 453 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.64 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  39.28 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38.76 
 
 		 442 aa  319  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.82 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.72 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.78 
 
 		 434 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.77 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.6 
 
 		 457 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.82 
 
 		 438 aa  316  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  39.22 
 
 		 427 aa  315  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.12 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  39.46 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  39.37 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.56 
 
 		 453 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.82 
 
 		 438 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.82 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  40.68 
 
 		 434 aa  312  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.78 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  39.34 
 
 		 454 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.36 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.11 
 
 		 434 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.11 
 
 		 434 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 		 433 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  40.45 
 
 		 434 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  41.59 
 
 		 464 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  41.12 
 
 		 437 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  38.29 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.77 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  39.25 
 
 		 454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.19 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  41.12 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  41.59 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  37.36 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  37.36 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.81 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  40.45 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  37.19 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.31 
 
 		 438 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.55 
 
 		 436 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.26 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.54 
 
 		 478 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.6 
 
 		 442 aa  307  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.32 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.51 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  40 
 
 		 456 aa  305  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.69 
 
 		 457 aa  305  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.41 
 
 		 440 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  39.68 
 
 		 434 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 		 440 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>