More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1159 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
434 aa  864    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  81.12 
 
 
454 aa  588  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.96 
 
 
437 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  56.35 
 
 
438 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.82 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  54.09 
 
 
439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  53.32 
 
 
440 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  55.17 
 
 
439 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  54.79 
 
 
494 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  57.81 
 
 
435 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  52.21 
 
 
465 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  53.28 
 
 
443 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.07 
 
 
439 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.79 
 
 
440 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.79 
 
 
440 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  51.05 
 
 
443 aa  362  9e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  49.74 
 
 
494 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  51.84 
 
 
437 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.23 
 
 
444 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.92 
 
 
446 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  51.17 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.79 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 
439 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  50.52 
 
 
477 aa  352  7e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.13 
 
 
442 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.13 
 
 
442 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  50 
 
 
434 aa  350  4e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  51.44 
 
 
452 aa  350  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  48.29 
 
 
437 aa  349  5e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.19 
 
 
444 aa  346  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.82 
 
 
440 aa  345  8.999999999999999e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.89 
 
 
488 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.23 
 
 
490 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.84 
 
 
465 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.66 
 
 
495 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  50.39 
 
 
443 aa  328  9e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.87 
 
 
462 aa  324  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  46.39 
 
 
474 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.21 
 
 
438 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.64 
 
 
475 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.12 
 
 
475 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.97 
 
 
547 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.74 
 
 
441 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  43.39 
 
 
438 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  43.12 
 
 
434 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.88 
 
 
478 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.78 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 
434 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.59 
 
 
434 aa  274  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.06 
 
 
434 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.85 
 
 
434 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  40 
 
 
473 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.64 
 
 
437 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  40.81 
 
 
464 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0413  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.9 
 
 
440 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.394208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.52 
 
 
442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.27 
 
 
437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  39.79 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.84 
 
 
467 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.99 
 
 
438 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  39.68 
 
 
437 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  39.68 
 
 
437 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  40.21 
 
 
443 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1350  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.23 
 
 
441 aa  266  8e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000563405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.75 
 
 
434 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.75 
 
 
434 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.75 
 
 
434 aa  265  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0495  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.06 
 
 
440 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.156569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.67 
 
 
438 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
447 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  42.59 
 
 
440 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
452 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.37 
 
 
436 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.84 
 
 
460 aa  264  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  37.34 
 
 
443 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  42.18 
 
 
439 aa  262  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  39.64 
 
 
440 aa  262  8.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.73 
 
 
436 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.78 
 
 
438 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.84 
 
 
442 aa  262  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  41.53 
 
 
463 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38.52 
 
 
442 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  37.68 
 
 
457 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  40.21 
 
 
434 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  40.21 
 
 
434 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.27 
 
 
438 aa  260  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.05 
 
 
438 aa  260  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  38.61 
 
 
438 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.6 
 
 
446 aa  260  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.12 
 
 
474 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.1 
 
 
442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  39.95 
 
 
464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  39.69 
 
 
464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.15 
 
 
453 aa  259  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.79 
 
 
434 aa  259  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  39.13 
 
 
437 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  39.13 
 
 
437 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>