More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5905 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
495 aa  962    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.75 
 
 
444 aa  569  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.88 
 
 
547 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  60.99 
 
 
443 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.71 
 
 
439 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  60.86 
 
 
437 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.6 
 
 
465 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.29 
 
 
439 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  59.7 
 
 
439 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.62 
 
 
442 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.06 
 
 
446 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.49 
 
 
444 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.02 
 
 
475 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.93 
 
 
442 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.93 
 
 
442 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.86 
 
 
490 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  57.51 
 
 
438 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  56.87 
 
 
437 aa  488  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.18 
 
 
475 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.6 
 
 
456 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.66 
 
 
440 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  56.13 
 
 
494 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.66 
 
 
440 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  56.65 
 
 
443 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  54.7 
 
 
465 aa  478  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.05 
 
 
488 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  56.64 
 
 
434 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  55.34 
 
 
439 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.88 
 
 
462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.56 
 
 
437 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.42 
 
 
440 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  56.32 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  55.18 
 
 
477 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  51.17 
 
 
440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  56.68 
 
 
443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  53.25 
 
 
452 aa  437  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  49.79 
 
 
474 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  56.22 
 
 
435 aa  428  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  51.89 
 
 
494 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.14 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.74 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.63 
 
 
441 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  48.41 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.34 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.15 
 
 
438 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.9 
 
 
451 aa  332  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.51 
 
 
438 aa  329  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  39.19 
 
 
443 aa  326  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.85 
 
 
440 aa  326  7e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.85 
 
 
440 aa  326  7e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  40.99 
 
 
446 aa  323  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.3 
 
 
434 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.3 
 
 
434 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.79 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.81 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.56 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  38.66 
 
 
442 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.29 
 
 
434 aa  320  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  36.07 
 
 
427 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.56 
 
 
437 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.64 
 
 
438 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  38.88 
 
 
441 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  42.4 
 
 
463 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  38.94 
 
 
466 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  41.45 
 
 
437 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  41.24 
 
 
437 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.35 
 
 
434 aa  317  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.86 
 
 
438 aa  316  8e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  39.96 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  39.74 
 
 
433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  40.9 
 
 
456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.54 
 
 
478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  41.94 
 
 
464 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  39.22 
 
 
439 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.01 
 
 
436 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  40.17 
 
 
434 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  35.27 
 
 
437 aa  312  9e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 
434 aa  312  9e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  35.27 
 
 
437 aa  312  9e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.17 
 
 
434 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  41.59 
 
 
452 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  36.27 
 
 
443 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.78 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.29 
 
 
437 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  35.34 
 
 
435 aa  310  4e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.54 
 
 
436 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38.15 
 
 
442 aa  310  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  41.36 
 
 
434 aa  310  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  41.36 
 
 
434 aa  310  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  40.09 
 
 
436 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  39.96 
 
 
438 aa  309  9e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.91 
 
 
442 aa  309  9e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  38.36 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  39.96 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  42.58 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  42.58 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  39.96 
 
 
438 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.05 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.4 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>