More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 437 aa  877    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.33 
 
 		 439 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.59 
 
 		 456 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.24 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  61.64 
 
 		 438 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  61.14 
 
 		 439 aa  524  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.77 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.82 
 
 		 444 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.23 
 
 		 446 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  59.4 
 
 		 443 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.81 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  60.5 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.54 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.81 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.41 
 
 		 442 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.41 
 
 		 442 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  59.5 
 
 		 437 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  59.32 
 
 		 443 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.7 
 
 		 440 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  59.01 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  58.37 
 
 		 465 aa  498  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  59.4 
 
 		 477 aa  495  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  58.12 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  60.91 
 
 		 439 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.7 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  56.75 
 
 		 452 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.77 
 
 		 444 aa  488  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.65 
 
 		 495 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55 
 
 		 547 aa  478  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.54 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.3 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.99 
 
 		 462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.9 
 
 		 475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.34 
 
 		 475 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  56.98 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  56.12 
 
 		 434 aa  461  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  57.3 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  58.09 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  49.55 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.46 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.02 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.69 
 
 		 434 aa  352  5.9999999999999994e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  48.29 
 
 		 434 aa  349  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.29 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.74 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  42.76 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  44.22 
 
 		 447 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  42.66 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.21 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.21 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  42.2 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.73 
 
 		 446 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.4 
 
 		 438 aa  336  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.91 
 
 		 434 aa  335  7e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.42 
 
 		 451 aa  335  7.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.48 
 
 		 440 aa  335  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  43.55 
 
 		 464 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.86 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  39.77 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.53 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  38.72 
 
 		 443 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.47 
 
 		 467 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  40.87 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.28 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.58 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.51 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  41.55 
 
 		 449 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  42.08 
 
 		 473 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.32 
 
 		 440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.32 
 
 		 440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.64 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  41.78 
 
 		 456 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.87 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.32 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  43.28 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.6 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  41.28 
 
 		 438 aa  326  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.06 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.53 
 
 		 445 aa  325  7e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.08 
 
 		 458 aa  325  7e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  41.28 
 
 		 438 aa  325  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.97 
 
 		 433 aa  325  9e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.28 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  41.06 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.83 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.51 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.99 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.55 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  40.99 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.95 
 
 		 457 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.63 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  38.81 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  38.81 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  42.14 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.55 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  42.14 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  41.42 
 
 		 439 aa  322  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  41.09 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>