More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3900 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  72.17 
 
 		 439 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 456 aa  916    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  69.63 
 
 		 438 aa  617  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.61 
 
 		 437 aa  614  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  71.82 
 
 		 439 aa  611  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  67.86 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.72 
 
 		 439 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.12 
 
 		 442 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.98 
 
 		 444 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.3 
 
 		 446 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.21 
 
 		 439 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  61.88 
 
 		 443 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.22 
 
 		 442 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  60.59 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.22 
 
 		 442 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  62.3 
 
 		 437 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  60.18 
 
 		 440 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  61.04 
 
 		 465 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  60.91 
 
 		 434 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  63.72 
 
 		 435 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.82 
 
 		 440 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  59.96 
 
 		 443 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.82 
 
 		 440 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  56.24 
 
 		 452 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.62 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.37 
 
 		 440 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  57.72 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  59.82 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  56.56 
 
 		 477 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  60.05 
 
 		 443 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.09 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.39 
 
 		 495 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.34 
 
 		 465 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.5 
 
 		 547 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.51 
 
 		 454 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.79 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.64 
 
 		 490 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.54 
 
 		 475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.76 
 
 		 475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  50.99 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  55.82 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.01 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.1 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.8 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.53 
 
 		 451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.63 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.4 
 
 		 434 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  42.31 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  42.4 
 
 		 438 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  42.4 
 
 		 438 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  41.67 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  41.72 
 
 		 433 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.89 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  40.95 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  42.18 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  40.95 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.53 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.67 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.67 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.66 
 
 		 438 aa  329  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  41.67 
 
 		 454 aa  329  7e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  39.68 
 
 		 442 aa  328  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 		 443 aa  329  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.95 
 
 		 438 aa  329  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.7 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.83 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.36 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  41.45 
 
 		 454 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.84 
 
 		 427 aa  325  8.000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  39.64 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.31 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.21 
 
 		 438 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  40.54 
 
 		 446 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  37.98 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  42.67 
 
 		 440 aa  323  6e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.1 
 
 		 478 aa  323  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  40.14 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.14 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  41.53 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.63 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  41.4 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  41.11 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.39 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.22 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  41.63 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.63 
 
 		 437 aa  319  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  40.58 
 
 		 449 aa  319  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.79 
 
 		 503 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.17 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.89 
 
 		 478 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.07 
 
 		 447 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.09 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.36 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  40.54 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.6 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.57 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.23 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>