More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1006 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
435 aa  852    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  64.29 
 
 
438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.72 
 
 
456 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.99 
 
 
437 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  62.84 
 
 
439 aa  547  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.7 
 
 
439 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  63.3 
 
 
439 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  59.32 
 
 
440 aa  525  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.5 
 
 
439 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.23 
 
 
442 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  59.95 
 
 
443 aa  501  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  60.32 
 
 
465 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  60.77 
 
 
439 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.59 
 
 
446 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.09 
 
 
442 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.09 
 
 
442 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.36 
 
 
444 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  59.36 
 
 
494 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.56 
 
 
444 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  59.36 
 
 
437 aa  481  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.56 
 
 
440 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.44 
 
 
440 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.44 
 
 
440 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  59.45 
 
 
443 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  58.09 
 
 
437 aa  474  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.68 
 
 
454 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.23 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  57.08 
 
 
452 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  59.1 
 
 
494 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.51 
 
 
495 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  57.67 
 
 
477 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  58.29 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  58.9 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.27 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.95 
 
 
465 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.43 
 
 
547 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.28 
 
 
488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.21 
 
 
475 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.21 
 
 
475 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  50.67 
 
 
474 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  57.81 
 
 
434 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.32 
 
 
438 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 
441 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.45 
 
 
451 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.21 
 
 
438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.68 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.68 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.59 
 
 
434 aa  319  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  42.11 
 
 
434 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.92 
 
 
434 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  41.14 
 
 
443 aa  317  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  42.11 
 
 
434 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  42.21 
 
 
453 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.6 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.27 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.27 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  43.69 
 
 
447 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  42.05 
 
 
439 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.24 
 
 
434 aa  313  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  42.92 
 
 
456 aa  312  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  42.89 
 
 
449 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  40.37 
 
 
442 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  42.83 
 
 
441 aa  310  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.82 
 
 
427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.4 
 
 
438 aa  309  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.02 
 
 
440 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  42.08 
 
 
473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  38.83 
 
 
438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.09 
 
 
459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  41.72 
 
 
435 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  39.36 
 
 
438 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  38.9 
 
 
437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  38.9 
 
 
437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
463 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.14 
 
 
449 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.7 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  41 
 
 
446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  42.43 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.2 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  42.43 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.65 
 
 
478 aa  302  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  41.82 
 
 
464 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.79 
 
 
453 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  37.05 
 
 
435 aa  302  7.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.51 
 
 
434 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.95 
 
 
442 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.24 
 
 
438 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  42.66 
 
 
452 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  40.37 
 
 
441 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.38 
 
 
436 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  41.28 
 
 
433 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.32 
 
 
437 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.47 
 
 
438 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  43.15 
 
 
436 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.14 
 
 
442 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  38.12 
 
 
450 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  41.65 
 
 
436 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  38.34 
 
 
450 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  43.15 
 
 
435 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>