More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2901 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  894    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  67.88 
 
 
494 aa  605  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.67 
 
 
439 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  67.59 
 
 
437 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.59 
 
 
439 aa  570  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.74 
 
 
490 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  65.52 
 
 
443 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  61.87 
 
 
438 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.06 
 
 
462 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60 
 
 
442 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.5 
 
 
547 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.13 
 
 
475 aa  532  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.99 
 
 
495 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 
442 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 
442 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  62.95 
 
 
439 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.69 
 
 
475 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.68 
 
 
440 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.96 
 
 
456 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  60.14 
 
 
439 aa  511  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.81 
 
 
444 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.27 
 
 
440 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.27 
 
 
440 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  59.4 
 
 
437 aa  509  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  56.35 
 
 
474 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  59.63 
 
 
434 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.04 
 
 
444 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.21 
 
 
446 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  60.36 
 
 
439 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  58.03 
 
 
443 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  57.08 
 
 
477 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  57.24 
 
 
452 aa  492  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  55.08 
 
 
440 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  57.4 
 
 
465 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.52 
 
 
465 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.86 
 
 
437 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  59.95 
 
 
435 aa  467  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.09 
 
 
488 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.01 
 
 
454 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.26 
 
 
438 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  53.81 
 
 
494 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.3 
 
 
441 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  51.05 
 
 
434 aa  362  9e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.89 
 
 
434 aa  353  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.39 
 
 
438 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.69 
 
 
451 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  41.24 
 
 
446 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.72 
 
 
438 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.51 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.97 
 
 
434 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  40.32 
 
 
441 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.97 
 
 
434 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  41.23 
 
 
473 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  41.51 
 
 
459 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.74 
 
 
471 aa  333  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  40.32 
 
 
440 aa  333  3e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.05 
 
 
436 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.09 
 
 
442 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  38.75 
 
 
427 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.82 
 
 
434 aa  331  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  43.05 
 
 
436 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  43.05 
 
 
435 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.61 
 
 
439 aa  329  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41 
 
 
467 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38.99 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.69 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  41.74 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.05 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.74 
 
 
437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  40.96 
 
 
453 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.83 
 
 
438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  42.07 
 
 
436 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
443 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.69 
 
 
436 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  42.3 
 
 
463 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  36.93 
 
 
443 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 
445 aa  323  4e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.69 
 
 
436 aa  322  6e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  38.7 
 
 
457 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
437 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  40.18 
 
 
466 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  40.14 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  41.94 
 
 
452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.14 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.92 
 
 
438 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  37.21 
 
 
435 aa  319  7.999999999999999e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  40.92 
 
 
440 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.69 
 
 
436 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  38.65 
 
 
449 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  38.65 
 
 
449 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  39.86 
 
 
439 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.74 
 
 
436 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
440 aa  318  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.79 
 
 
453 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  39.18 
 
 
448 aa  317  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.72 
 
 
442 aa  317  2e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40 
 
 
445 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  39.86 
 
 
450 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  41.23 
 
 
434 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  41.23 
 
 
434 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>