More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2984 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 434 aa  874    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.28 
 
 		 442 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.66 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.66 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.68 
 
 		 446 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.68 
 
 		 444 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  65.66 
 
 		 443 aa  578  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.27 
 
 		 439 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  63.19 
 
 		 437 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.5 
 
 		 439 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.91 
 
 		 456 aa  542  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  61.93 
 
 		 465 aa  534  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  61.47 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  61.73 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  59.63 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  59.68 
 
 		 438 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.59 
 
 		 440 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.2 
 
 		 490 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  60.41 
 
 		 439 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  58 
 
 		 494 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.18 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  59.26 
 
 		 452 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.12 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.4 
 
 		 495 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  57.87 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  56.12 
 
 		 437 aa  481  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.32 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.32 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.86 
 
 		 488 aa  474  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.41 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.73 
 
 		 475 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  54.9 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.74 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  57.74 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.99 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  57.83 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  51.58 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.9 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.78 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.09 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  51.47 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.66 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  50 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.86 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.13 
 
 		 451 aa  346  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  46.75 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  45.29 
 
 		 456 aa  342  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  42.13 
 
 		 442 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.66 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.23 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.35 
 
 		 434 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.35 
 
 		 434 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  44.24 
 
 		 440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.23 
 
 		 434 aa  335  7e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  42.73 
 
 		 434 aa  335  9e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  41.67 
 
 		 441 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  42.59 
 
 		 438 aa  334  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  42.59 
 
 		 438 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  42.36 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.82 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.82 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  42.36 
 
 		 438 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  42.49 
 
 		 434 aa  332  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.96 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  42.13 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  43.75 
 
 		 452 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  41.11 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  41.47 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.27 
 
 		 438 aa  330  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.34 
 
 		 437 aa  328  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  43.29 
 
 		 463 aa  328  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 		 445 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  42.66 
 
 		 439 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.67 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  39.95 
 
 		 445 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  42.07 
 
 		 435 aa  325  9e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  43.02 
 
 		 464 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  38.48 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.73 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.84 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.91 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  40.28 
 
 		 442 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.4 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.78 
 
 		 436 aa  322  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  39.22 
 
 		 459 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 		 473 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.4 
 
 		 438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  42.01 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 		 438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  41.32 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.44 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.78 
 
 		 443 aa  319  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  39.03 
 
 		 438 aa  318  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.73 
 
 		 444 aa  318  9e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  42.27 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.73 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  40.45 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.63 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>