More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7280 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
465 aa  923    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.84 
 
 
444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.6 
 
 
495 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.36 
 
 
439 aa  534  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  60.52 
 
 
443 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.34 
 
 
456 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.3 
 
 
439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  58.3 
 
 
437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  60.13 
 
 
437 aa  514  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  59.2 
 
 
438 aa  501  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  58.72 
 
 
439 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  59.26 
 
 
439 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.42 
 
 
442 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.42 
 
 
442 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.11 
 
 
442 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  56.99 
 
 
494 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.21 
 
 
446 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.52 
 
 
547 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.61 
 
 
437 aa  484  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  57.21 
 
 
465 aa  484  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.54 
 
 
490 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.45 
 
 
475 aa  481  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  58.26 
 
 
443 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.55 
 
 
444 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.48 
 
 
440 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.48 
 
 
440 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  57.84 
 
 
439 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  60.18 
 
 
443 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  54.75 
 
 
440 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.03 
 
 
475 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.57 
 
 
462 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  55.27 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.8 
 
 
440 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  59.25 
 
 
435 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  54.51 
 
 
477 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  55 
 
 
488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  51.81 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  55.09 
 
 
434 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.42 
 
 
454 aa  438  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  55.16 
 
 
494 aa  433  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  55.84 
 
 
434 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.48 
 
 
438 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.06 
 
 
441 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  39.01 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.52 
 
 
438 aa  332  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.39 
 
 
459 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  40.44 
 
 
446 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.35 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.3 
 
 
438 aa  326  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  39.57 
 
 
466 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  39.34 
 
 
441 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  39.07 
 
 
427 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.39 
 
 
434 aa  322  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.04 
 
 
434 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  41.67 
 
 
437 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  41.67 
 
 
437 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  38.9 
 
 
442 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  39.47 
 
 
443 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.78 
 
 
438 aa  317  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.52 
 
 
436 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.17 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  38.21 
 
 
437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  38.21 
 
 
437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  40.79 
 
 
435 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.92 
 
 
438 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.96 
 
 
437 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.89 
 
 
437 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  39.61 
 
 
450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38.15 
 
 
442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.06 
 
 
478 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  39.25 
 
 
434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.09 
 
 
440 aa  307  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.09 
 
 
440 aa  307  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 
440 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  39.61 
 
 
464 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.22 
 
 
435 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1350  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.85 
 
 
441 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000563405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.48 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.58 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  39.04 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.58 
 
 
446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  41.05 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.17 
 
 
460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  36.82 
 
 
438 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.38 
 
 
434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.38 
 
 
434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.26 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  41.05 
 
 
435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  35.21 
 
 
440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.61 
 
 
436 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.31 
 
 
447 aa  303  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.39 
 
 
436 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  36.38 
 
 
435 aa  302  8.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  37.9 
 
 
448 aa  302  9e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.51 
 
 
434 aa  302  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.21 
 
 
439 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  39.61 
 
 
453 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.29 
 
 
445 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.61 
 
 
439 aa  300  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  39.44 
 
 
440 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>