More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5678 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.6 
 
 
475 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  964    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.96 
 
 
475 aa  630  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  56.35 
 
 
443 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  55.36 
 
 
437 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.79 
 
 
442 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.01 
 
 
439 aa  477  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.01 
 
 
439 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.46 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.46 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  51 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  52.23 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.44 
 
 
446 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.41 
 
 
444 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.09 
 
 
547 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.91 
 
 
490 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.33 
 
 
462 aa  438  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  49.55 
 
 
437 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.33 
 
 
444 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.66 
 
 
440 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.99 
 
 
456 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.79 
 
 
495 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.78 
 
 
440 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.78 
 
 
440 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  50.78 
 
 
438 aa  428  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.6 
 
 
488 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  49.56 
 
 
439 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  51.56 
 
 
443 aa  425  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  51.34 
 
 
443 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  50.99 
 
 
439 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  48.68 
 
 
477 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  51.58 
 
 
434 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.89 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  48.79 
 
 
452 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  50.78 
 
 
439 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.81 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  48.25 
 
 
440 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  50.44 
 
 
435 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.05 
 
 
454 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  48.8 
 
 
494 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.86 
 
 
438 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.01 
 
 
441 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.43 
 
 
434 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 
451 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.4 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  38.7 
 
 
446 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  46.39 
 
 
434 aa  324  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.31 
 
 
434 aa  323  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  39.29 
 
 
435 aa  322  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
447 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  40.53 
 
 
463 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.64 
 
 
438 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.29 
 
 
434 aa  320  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  37.69 
 
 
443 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  39.15 
 
 
433 aa  318  9e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  39.87 
 
 
434 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.89 
 
 
457 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  39.56 
 
 
439 aa  316  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.51 
 
 
438 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  39.42 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  39.2 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  38.93 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.17 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  38.93 
 
 
438 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.53 
 
 
438 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.42 
 
 
457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  40.04 
 
 
452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.43 
 
 
459 aa  312  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  38.48 
 
 
442 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  38.98 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  38.08 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  37.89 
 
 
458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  38.67 
 
 
473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  39.51 
 
 
436 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.84 
 
 
427 aa  310  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  38.31 
 
 
456 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  38.48 
 
 
438 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4084  nucleotide sugar dehydrogenase  38.11 
 
 
458 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  37.8 
 
 
449 aa  309  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.67 
 
 
467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.53 
 
 
434 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.53 
 
 
434 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.08 
 
 
451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.73 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  39.41 
 
 
449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  38.03 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  37.86 
 
 
434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  37.22 
 
 
445 aa  307  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.96 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38 
 
 
442 aa  306  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  38.08 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37 
 
 
445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0620  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.53 
 
 
435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0934466  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.2 
 
 
460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  37.8 
 
 
445 aa  302  7.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.98 
 
 
439 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40 
 
 
436 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  38.5 
 
 
464 aa  302  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  37.78 
 
 
437 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  37.78 
 
 
437 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>